JAGS/BUGS 的 R 替代品

Question

是否有可用于贝叶斯参数估计的 R 包来替代 JAGS？我发现了一个关于 R 中 JAGS/BUGS 替代品的老问题，但是，最后一篇文章已经有 9 年历史了。那么，R 中是否有新的灵活的 gibbs 采样包可用？我想用它来获得具有随机效应和协变量等的新型分层隐藏马尔可夫模型的参数估计。我高度重视 JAGS 的灵活性并认为 JAGS 简直太棒了，但是，我想编写 R 函数来促进模型规范和我正在寻找一个可用于参数估计的包。

Answer 1

有一些选择：

• stan，带有 rstan R 包。 Stan 看起来优化得很好，但不能做某些类型的模型（比如二项式/泊松混合模型），因为他不能采样离散变量（或类似的东西......）。

• 灵活

• 如果您想基于 C++ 进行高度优化的采样，您可能需要查看Rcpp based solutions from Dirk Eddelbuettel