coda.samples 中的迭代次数和细值

Question

关于 rjags 中的以下 coda.samples，

samples<-coda.samples(jags,
                      c('B', 'A'),
                      5000,thin=5)

迭代设置为5000，thin 参数设置为5。在贝叶斯分析中是否有设置这两个参数的机制或​​规则。

Answer 1

您的意思是“有没有办法为这些参数定义‘正确’或‘最佳’值？
如果是这样，那么答案是“否”。不在 R 或任何语言中。您需要查看模型拟合的诊断（例如迹线图、Gelman-Rubin、Raftery-Lewis 和 Heidelberger-Welch 统计）并调整 MCMC 过程的参数，直到获得“可接受的”结果。这是一门艺术，而不是确定性算法。

您还应该查看您使用的链条数量，以及每个链条的老化、细化和其他参数。