当有已安装的包链接到旧的 Python 时，安装更新的 Python

Question

（请耐心等待我的描述，这是一个相当长的故障排除之旅。）

我的最终目标是让 python 包 graph_tool 在我的系统上运行，如果可能的话也在 ipynb 上运行。我已经有brew install graph-tool、as indicated here，但还是不够。

所以我关注conda instructions here，并尝试满足所有要求，包括拥有cgal 和python3.6。我最初有 python2.7 和 python3.5 的 anaconda，但由于 python3.6 是必需的，我下载了带有 python3.6 的 anaconda3。 （conda update python 仍然给我 3.5）

我删除 /Users/mymacbook/anaconda，以便 /Users/mymacbook/anaconda3 成为默认搜索目录。我有一个小成功！

$ python3
Python 3.6.2 |Anaconda, Inc.| (default, Sep 21 2017, 18:29:43) 
[GCC 4.2.1 Compatible Clang 4.0.1 (tags/RELEASE_401/final)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.

不幸的是，当我继续conda install 所需的其他软件包（boost、cgal 等）时，我的 python3 恢复到 3.5 :(

$ python3
Python 3.5.4 |Anaconda custom (x86_64)| (default, Oct  5 2017, 02:58:14)

$ conda install python=3.6
Fetching package metadata ...........
Solving package specifications: .

UnsatisfiableError: The following specifications were found to be in conflict:
  - cgal -> python 3.5*
  - python 3.6*
Use "conda info <package>" to see the dependencies for each package.

$ conda info cgal
Fetching package metadata ...........

ResolvePackageNotFound: 
  - cgal

很麻烦不是吗...由于 ResolvePackageNotFound，建议卸载 cgal，但就像我提到的，我需要 cgal 和 python3.6。

提前感谢您的帮助！ （并且请在您的建议中包含适用的命令行 - 我是初学者）

Answer 1

寻找软件包当您执行 conda create .. 或 conda install ... 甚至是 conda search 时，它只会显示与您的操作系统一致的结果，在某些情况下，会显示与基本 python 版本一致的结果.

什么是真正可用的 您可以直接转到Anaconda.org 并搜索您的包裹。这将在“官方”anaconda 分发包以外的渠道上构建。但是，在查看此处时，您必须手动查看可用的文件，因为有些文件可能不是为您的操作系统构建的。

查看conda info 的结果以查看您当前的频道。看起来“conda-forge”频道可能有你想要的东西。

conda create -n tamtams_project ipython cgal --channel conda-forge

当我偏离默认频道时，我更喜欢知道包裹来自哪里。您始终可以通过使用以下命令添加到 .condarc 文件来查看该信息：

conda config --set show_channel_urls True

上面的创建将显示几乎所有的包都是 conda-forge 包，因为命令行通道成为首选通道。

因此，一个次要的偏好可能是使用：

conda create -n tamtams_project ipython cgal -c defaults -c conda-forge 

然后您会看到大多数软件包是默认软件包，其中两个来自 conda-forge。

Answer 2

您安装的 cgal 副本是为 Python 3.5 编译的。如果您查看 https://anaconda.org/conda-forge/cgal/files ，每个 Python 次要版本都有一个单独的包。

Managing Python — Conda documentation 推荐任一

• 如果您不想替换现有安装，请将新的 Python 安装到新环境，或者
• update'ing 它（如果需要，连同其他包一起）如果您确实想替换当前的包

当然，您也可以卸载所有特定于版本的包，安装新的 Python，然后重新安装包 - 但这需要更多的工作。