在 Py4neo 中创建现有节点之间的关系答案

【问题标题】：create relationship between existing nodes in Py4neo在 Py4neo 中创建现有节点之间的关系
【发布时间】：2021-06-01 09:05:09
【问题描述】：

我有一个基因名称列表genes_list 和一个针对其他基因的基因列表（元组列表）genes2，我成功连接到我的本地数据库并创建了标记为GEN 和@987654324 的20244 个节点@ 财产。我正在尝试生成一个脚本，该脚本自动为 Neo4j 图中的任何一对节点（使用变量tupla[0]and tupla[1]）创建关系，但我无法让 for 循环为元组列表工作，有什么建议吗？我还在学习如何使用这个库，任何建议都会很棒！问候！

from py2neo import Node,Relationship,Graph, database,NodeMatcher  
import time
import pandas as pd

genes_list=pd.read_csv("Gen_list.txt",delimiter="\t",header=None)
genes_list=genes_list[0].tolist()
for name in genes_list:
    graph.run("CREATE(:GEN{name:$name})",name=name)

genes=pd.read_csv(r"C:\Users\espin\OneDrive\Escritorio\MCI\SCRIPTS\dorothea_final.csv", delimiter="\t",header=None)
genes2=list(genes.to_records(index=False))

for tupla in genes2:
    existing_u1 = matcher.match("GEN").where(name=tupla[0]).first()
    existing_u2 = matcher.match("GEN").where(name=tupla[1).first()
    graph.merge(existing_u1,"REGULATES", existing_u2)

【问题讨论】：

您遇到的错误是什么？
当我运行最后 4 行时，我得到这个： AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'db_merge' 在处理上述异常期间，发生了另一个异常：merge = subgraph.__db_merge__ AttributeError: 'NoneType' 对象没有属性 'db_merge' TypeError("No method defined to merge object %r" % subgraph) TypeError: No method defined to merge object None

标签： neo4j py2neo

【解决方案1】：

我发现，对于想要尝试此实现并正在使用 py2neo V4 的人，请尝试使用 graph.run()

for tupla in genes2:
    graph.run("MATCH(a:GEN{name:$name}) MATCH(b:GEN{name:$name1}) CREATE (a)-[:REGULATES]->(b)",name=tupla[0],name1=tupla[1])

请记住，查询必须在第一个参数中，然后声明 $variables 以“，”分隔当您已经创建节点并且不复制现有节点时，这至少可以工作。

【讨论】：