如何计算成对行之间的结果差异？

【问题标题】：How to calculate the difference in results between paired rows?如何计算成对行之间的结果差异？
【发布时间】：2017-11-27 21:48:14
【问题描述】：

假设我有以下数据框：

  Sample_Type  test_result
GeneA(normal)    10
 GeneA(tumor)     5
GeneB(normal)     2
 GeneB(tumor)    -6

如何计算Sample_Type 下相同基因的test_result 值之间的差异？

想要的输出是：

              Sample_Type  diff_value
GeneA(normal)-GeneA(tumor)          5
GeneB(normal)-GeneB(tumor)         10

知道如何解决这个问题吗？

【问题讨论】：

【解决方案1】：

使用groupby 和extract：

df.groupby(df.Sample_Type.str.extract('(\w+{5})', expand=False))['test_result'].apply(lambda x: x.iloc[0]-x.iloc[1])

输出：

Sample_Type
GeneA    5
GeneB    8
Name: test_result, dtype: int64

【讨论】：