【问题标题】:Saving to Parquet throws an error in Dask.dataframe保存到 Parquet 会在 Dask.dataframe 中引发错误
【发布时间】:2021-03-25 06:41:12
【问题描述】:

执行操作时:Dask.dataframe.to_parquet(data),如果通过Dask 以给定数量的分区读取data,并且您在删除一些列后尝试以镶木地板格式保存它,它会失败,例如以下错误:

FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: part.0.parquet'

有人遇到过同样的问题吗?

这是一个最小的示例 - 请注意方式 1 可以按预期工作,而方式 2 则不能:

import numpy as np
import pandas as pd
import dask.dataframe as dd

# -------------
# way 1 - works
# -------------
print('way 1 - start')
A = np.random.rand(200,300)
cols = np.arange(0, A.shape[1])
cols = [str(col) for col in cols]
df = pd.DataFrame(A, columns=cols)
ddf = dd.from_pandas(df, npartitions=11)

# compute and resave
ddf.drop(cols[0:11], axis=1)
dd.to_parquet(
    ddf, 'error.parquet', engine='auto', compression='default',
    write_index=True, overwrite=True, append=False)
print('way 1 - end')

# ----------------------
# way 2 - does NOT work 
# ----------------------
print('way 2 - start')
ddf = dd.read_parquet('error.parquet')

# compute and resave
ddf.drop(cols[0:11], axis=1)
dd.to_parquet(
    ddf, 'error.parquet', engine='auto', compression='default',
    write_index=True, overwrite=True, append=False)
print('way 2 - end')

【问题讨论】:

    标签: python python-3.x dask parquet dask-dataframe


    【解决方案1】:

    哦,太好了,由于overwrite=True 选项,您发现了一个错误。因此,当设置了overwrite=True 选项时会发生什么,dask 删除了路径,请参阅these lines。现在,在您的示例中,ddf 是惰性的,所以当需要写入数据时,dask 会尝试读取文件,但它们现在已经消失了。

    因此一种解决方案是将新数据框保存到不同的路径,然后删除旧文件夹并将新数据框的文件夹移动到旧文件夹(一些选项是here)。

    另一种选择是将ddf 加载到内存中(如果合适的话),然后使用您的代码:

    print('way 2 - start')
    ddf = dd.read_parquet('error.parquet')
    
    # # compute and persist in memory (note do not use
    # # .compute because the dataframe will turn into
    # # pandas data frame
    ddf = ddf.drop(cols[0:11], axis=1)
    ddf = ddf.persist()
    dd.to_parquet(
        ddf, 'error.parquet', engine='auto', compression='default',
        write_index=True, overwrite=True, append=False)
    # print('way 2 - end')
    

    附带说明,当您运行 ddf.drop(cols[0:11], axis=1) 时,如果您希望在数据框中更改它,则需要分配它:

    ddf = ddf.drop(cols[0:11], axis=1)
    

    更新:有一些相关讨论here

    【讨论】:

    • 谢谢@SultanOrazbayev,我修改了问题并添加了一个最小示例
    • 谢谢@SultanOrazbayev,这就是我想要的!是的,这对我来说似乎是一个错误。
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