Apache Kudu 插入速度慢，排队时间长答案

【问题标题】：Apache Kudu slow insert, high queuing timeApache Kudu 插入速度慢，排队时间长
【发布时间】：2018-08-13 04:55:16
【问题描述】：

我一直使用 Spark Data Source 从 Parquet 写入 Kudu，写入性能很糟糕：大约 12000 行 / 秒。每行大约 160 个字节。

我们有 7 个 kudu 节点，24 个核心 + 每个 64 GB RAM + 每个 12 个 SATA 磁盘。似乎没有任何资源成为瓶颈：tserver cpu 使用 ~3-4 核，RAM 10G，没有磁盘拥塞。

我仍然看到大部分时间写入请求都停留在排队中。任何想法都表示赞赏。

W0811 12:34:03.526340  7753 rpcz_store.cc:251] Call kudu.tserver.TabletServerService.Write from 10.60.170.18:10000 (ReqId={client: 81ae6f3c6e1b4d9493ea95f87ccd1dfa, seq_no=9365, attempt_no=1}) took 13255ms (client timeout 10000).
W0811 12:34:03.526489  7753 rpcz_store.cc:255] Trace:
0811 12:33:50.270477 (+     0us) service_pool.cc:163] Inserting onto call queue
0811 12:33:50.270497 (+    20us) service_pool.cc:222] Handling call
0811 12:34:03.526316 (+13255819us) inbound_call.cc:157] Queueing success response
Related trace 'txn':
0811 12:34:03.328337 (+     0us) write_transaction.cc:101] PREPARE: Starting
0811 12:34:03.328563 (+   226us) write_transaction.cc:268] Acquiring schema lock in shared mode
0811 12:34:03.328564 (+     1us) write_transaction.cc:271] Acquired schema lock
0811 12:34:03.328564 (+     0us) tablet.cc:400] PREPARE: Decoding operations
0811 12:34:03.328742 (+   178us) tablet.cc:422] PREPARE: Acquiring locks for 24 operations
0811 12:34:03.447163 (+118421us) lock_manager.cc:377] Waited 118408us for lock on <redacted>
0811 12:34:03.447203 (+    40us) tablet.cc:426] PREPARE: locks acquired
0811 12:34:03.447203 (+     0us) write_transaction.cc:126] PREPARE: finished.
0811 12:34:03.447361 (+   158us) write_transaction.cc:136] Start()
0811 12:34:03.447366 (+     5us) write_transaction.cc:141] Timestamp: P: 1533965643563964 usec, L: 6
0811 12:34:03.447674 (+   308us) log.cc:582] Serialized 64909 byte log entry
0811 12:34:03.449561 (+  1887us) write_transaction.cc:149] APPLY: Starting
0811 12:34:03.526238 (+ 76677us) tablet_metrics.cc:365] ProbeStats: bloom_lookups=48,key_file_lookups=48,delta_file_lookups=24,mrs_lookups=0
0811 12:34:03.526260 (+    22us) log.cc:582] Serialized 237 byte log entry
0811 12:34:03.526268 (+     8us) write_transaction.cc:309] Releasing row and schema locks
0811 12:34:03.526280 (+    12us) write_transaction.cc:277] Released schema lock
0811 12:34:03.526300 (+    20us) write_transaction.cc:196] FINISH: updating metrics
Metrics: {"child_traces":[["txn",{"apply.queue_time_us":11,"cfile_cache_hit":205,"cfile_cache_hit_bytes":21900627,"num_ops":24,"prepare.queue_time_us":13057291,"prepare.run_cpu_time_us":1017,"prepare.run_wall_time_us":119378,"raft.queue_time_us":71,"raft.run_cpu_time_us":303,"raft.run_wall_time_us":304,"replication_time_us":2170,"row_lock_wait_count":1,"row_lock_wait_us":118408,"spinlock_wait_cycles":45824}]]}

【问题讨论】：

标签： performance apache-spark apache-kudu data-ingestion

【解决方案1】：

第一个挑战是，将一个 23M 行、包含 200 列的行表提取到 Kudu（按主键划分为 4 个哈希分区）需要很长时间。准确地说，它花费了 58 分钟，相当于每秒 63 行。我不敢相信 Kudu 这么慢，我们仔细检查了安装和配置文档。不幸的是，我们相信默认设置，正如我在 Kudu slack 频道上发现的（感谢 Will Berkeley！），有两个参数需要调整。具体来说：

memory_limit_hard_bytes 控制 Kudu 守护进程应该使用的内存总量。

maintenance_manager_num维护线程数，建议设置为磁盘数的1/3，用于Kudu

CDH Kudu 包裹的默认设置非常糟糕 - Kudu 受到 1Gb 内存的限制，并且仅使用 1 个维护线程。我们将后者设置为 4（12 个驱动器/3），将前者设置为 0（动态分配）。 CM 不想为memory_limit_hard_bytes 接受 0，我们不得不使用 CM 安全阀来覆盖它。一旦完成并且 Kudu 重新启动，我的第一个 23M 表在 240 秒内完成（每秒约 95k 行） - 好多了！从 Impala 到 Impala parquet 的 CTAS 仅需 60 秒。

【讨论】：

Tks Kishore，我已经按照建议（4）设置了维护线程，并且从一开始就将memory_limit_hard_bytes设置为0。我观察到刚开始时导入速度非常快，然后随着时间的推移变得越来越慢。有什么建议可能是罪魁祸首吗？
您至少可以记下您复制答案的原始帖子。这是 - boristyukin.com/benchmarking-apache-kudu-vs-apache-impala

【解决方案2】：

原来这是由于我们的数据重复。我们正在使用一个包含大约 120 万行的字段，其值（即空字符串）与 Kudu 中的主键相同。所以 Kudu 更新同一个密钥 120 万次，每次都需要获取锁，因此摄取速度会随着时间的推移而下降。

我们删除了重复的关键行，提取速度提高到 10 倍。

【讨论】：