为什么我的代码不会写入文件输出？赋值前引用的局部变量

Question

我编写了一些代码来读取我的文本文件，找到一组与基因相关的数字，然后使用这些数字来搜索基因本身，这样我就可以提取出一堆包含每个基因的文本文件。 我已经成功地得到了数字，但是我在文件写入方面遇到了问题。我收到错误“分配前引用的局部变量 'gene_substring'”。我做了一些研究并尝试使用 global 来修复它，但它在其他地方抛出了错误。

#function to extract the genes by using the numbers in my list
end_file = "/Users...."

def extract_genes(start_stop, genome_sequence):
    for start,stop in start_stop:
        # extracts start:stop gene from the sequence
            if start > stop:
                gene_substring = genome_sequence[0:start] + genome_sequence[stop:]

            # store in file
            with open(end_file + "/" + name + "+" + ".txt", "w",) as file:
                file.write(gene_substring)

#My code to get the output

work_dir = "/Users/"
for path in glob.glob(os.path.join(work_dir, "*.gbff")):
    numbers = extract_numbers(path)
    sequences = extract_seq(path)
    extract_genes(start_stop, sequences)
    print(path)

我该如何解决这个问题？谢谢:)

Answer 1

变量gene_substring仅在条件start > stop为真时初始化。但是如果不满足要求怎么办？你必须初始化变量gene_substring，或者干脆移动它

with open(end_file + "/" + name + "+" + ".txt", "w",) as file:
                file.write(gene_substring)

进入声明if start > stop:

另外，请确保 if 语句是正确的