使用foreach时是否在R中导入“并行”包答案

【问题标题】：whether to import "parallel" package in R when using foreach使用foreach时是否在R中导入“并行”包
【发布时间】：2013-09-07 05:43:57
【问题描述】：

我正在使用foreach R 包中的foreach() 函数进行并行计算。除了那个函数，我认为还需要在doMC 包中使用registerDoMC() 函数。

但是，当我编写DESCRIPTION 文件时，Imports 部分包含doMC (>= 1.3.0), foreach (>= 1.4.1)，但是当我运行我的代码时，错误指示：找不到iter 函数。因此，我还 import iterators 包。

好像还是有错误：mclapply()函数要被foreach()使用，而这个函数both出现在parallel和multicore包中。我在Imports 部分中包含了这两个包，但是当我运行search() 时，会出现警告：

Warning messages:
1: replacing previous import ‘mclapply’ when loading ‘parallel’ 
2: replacing previous import ‘mcparallel’ when loading ‘parallel’ 
3: replacing previous import ‘pvec’ when loading ‘parallel’

这很奇怪：即使我明确imports iterators 和multicore 的两个包，在加载我自己的包后我仍然无法使用它们的功能......相反，我必须明确运行：

library(iterators)
library(multicore)

为了在我的包中使用我自己的函数，它利用了并行计算。我的包裹写作有什么问题吗？非常感谢！

【问题讨论】：

标签： r foreach parallel-processing domc

【解决方案1】：

如果您通过将doMC 添加到“Depends”来修改您的DESCRIPTION 文件，那么“找不到iter 函数”错误应该会消失，来自foreach、iterators 和doMC 的函数将是加载包时可用，这似乎是您的偏好。 Writing R Extensions 的第一章讨论了“Imports”和“Depends”之间的区别。通常，最好使用“导入”以避免强制您的包的用户加载仅在包中需要但它有用途的包。

实际上，您看到的“找不到 iter 函数”错误是由 doMC 包中的错误引起的，使用“Depends”而不是“Imports”可以解决此错误。你的包应该只需要导入它直接使用的包，所以如果你没有明确地调用iter或mclapply，你不应该导入iterators、parallel或multicore。并且由于parallel 已包含multicore，因此您永远不应同时导入parallel 和multicore，这应该可以避免您看到的警告消息。

我已向软件包维护者提交了针对 doMC 错误的修复，因此您应该能够在下一版本的软件包中将 foreach 和 doMC 导入软件包而不会出现错误。

【讨论】：

非常感谢您的解决方案！是的，如果我将 doMC 放在 Depends 部分中，它确实有效；-)