【发布时间】:2017-11-10 15:13:06
【问题描述】:
假设我有一个Simulation 对象,其核心属性是一个参数字典,其格式如下:
@pytest.fixture
def param_base():
'''Dict of parameter defaults'''
return {
"fs" : 2e4,
"sweep_length" : 1,
"num_trials" : 300,
...
"pool_tau" : 1.00,
"quantal_size" : -10,
"a_tau" : (0.001,0.005)
}
我想编写一个 pytest 函数,它可以简单地运行这个模拟,其中每个参数都有一系列值。结构稍有不同的字典可以封装这个想法:
@pytest.fixture
def param_ranges():
'''Dict of parameter ranges'''
p_name = [
"cav_p_open",
"num_trials",
"num_stim",
"num_cav",
"cav_i",
"num_cav_ratio",
"vesicle_prox",
]
p_sets = [
[0,0.01,0.99,1], #cav_p_open
[1,10,300], #num_trials
[1,2,5], #num_stim
[1,3,10], #num_cav
[0,1,5,10], #cav_i
[1,2], #num_cav_ratio
[0,0.01,0.25,1], #vesicle_prox
]
return dict(zip(p_name,p_sets))
重要的是,我不想运行所有这些参数的所有组合,因为模拟的数量增长得太快了。我只想一次更改一个参数,而将其他参数保留为默认值。
我目前的解决方案如下(上面代码后继续):
parameter_names = [
"cav_p_open",
"num_trials",
"num_stim",
"num_cav",
"cav_i",
"num_cav_ratio",
"vesicle_prox",
]
@pytest.mark.parametrize("p_name", parameter_names)
def test_runModel_range_params(p_name,param_ranges,param_base):
alt_params = copy.deepcopy(param_base)
p_range = param_ranges[p_name]
for i in range(len(p_range)):
alt_params[p_name] = p_range[i]
SIM = utils.Simulation(params = alt_params)
效果很好,但是因为我在循环每个参数范围,所以我只能查看代码是否失败,因为 utils.Simulation 在特定参数的 some 值处失败,而不知道 哪个具体失败了。
所以我认为我正在寻找类似pytest.mark.parameterize 的嵌套版本,我可以在其中对每个参数的每个范围值运行test_runModel_range_params。
有什么想法吗?优雅加分!
【问题讨论】:
标签: python nested pytest parameterized-tests