无法使用 R 3.6 在 ubuntu 18.04 中安装 phytools答案

【问题标题】：cannot install phytools in ubuntu 18.04 with R 3.6无法使用 R 3.6 在 ubuntu 18.04 中安装 phytools
【发布时间】：2020-06-14 20:08:17
【问题描述】：

无法安装 phytools

用开发工具试过

library(devtools)
install_github("liamrevell/phytools")

和

install.packages("phytools")

我总是遇到同样的错误

ERROR: dependency ‘mnormt’ is not available for package ‘phytools’

我无法安装 mnormt，因为

package ‘mnormt’ is not available (for R version 3.6.3)

gfortran 已经安装在我的系统中

GNU Fortran (Ubuntu 7.5.0-3ubuntu1~18.04) 7.5.0

非常感谢任何帮助，谢谢

【问题讨论】：

【解决方案1】：

在 Ubuntu Linux 上，我无法让 R 更新到最新版本（撰写本文时 >4.0），因此，就像 Dirk 建议的那样，我必须安装旧版本的软件包，与我现在的 R 版本兼容正在运行。

我的 R 版本是 3.6.3，2020 年 2 月发布

我看到版本 1.5-6 是我的 R 版本之前的最新版本

按照这些页面：“安装旧版本的软件包”https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/219949047-Installing-older-versions-of-packages我将相关的 url 复制到此代码中并在 R 中运行它

packageurl <- "https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/mnormt/mnormt_1.5-6.tar.gz"
install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source")

这解决了我安装 mnormt 的问题，并且还允许以标准方式安装依赖它的软件包（据我测试）

【讨论】：

【解决方案2】：

mnormt 的当前版本取决于 R 的当前版本；你选择保留一个版本。

所以只需安装以前版本的mnormt，例如通过

cd /tmp
wget https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/mnormt/mnormt_1.5-7.tar.gz
R CMD INSTALL mnormt_1.5-7.tar.gz

在最后一个INSTALL 命令前加上sudo，或者更改/usr/local/lib/R/site-library 的权限/组成员资格，如果R 告诉你它不能在那里写。

安装mnormt 后，继续安装phytools。

【讨论】：

【解决方案3】：

尝试在安装命令中添加标签版本，例如：devtools::install_github('cran/mnormt@R-3.0.3')

检查您需要的版本并替换“@”后的标记。

【讨论】：