一次性计算精度、召回率和 F 分数 - python

Question

Accuracy, precision, recall and f-score 是机器学习系统中系统质量的度量。它取决于真/假阳性/阴性的混淆矩阵。

给定一个二元分类任务，我尝试了以下方法来获得一个返回准确率、精度、召回率和 f-score 的函数：

gold = [1] + [0] * 9
predicted = [1] * 10

def evaluation(gold, predicted):
  true_pos = sum(1 for p,g in zip(predicted, gold) if p==1 and g==1)
  true_neg = sum(1 for p,g in zip(predicted, gold) if p==0 and g==0)
  false_pos = sum(1 for p,g in zip(predicted, gold) if p==1 and g==0)
  false_neg = sum(1 for p,g in zip(predicted, gold) if p==0 and g==1)
  try:
    recall = true_pos / float(true_pos + false_neg)
  except:
    recall = 0
  try:
    precision = true_pos / float(true_pos + false_pos)
  except:
    precision = 0
  try:
    fscore = 2*precision*recall / (precision + recall)
  except:
    fscore = 0
  try:
    accuracy = (true_pos + true_neg) / float(len(gold))
  except:
    accuracy = 0
  return accuracy, precision, recall, fscore

但似乎我已经冗余循环数据集 4 次以获得真/假阳性/阴性。

另外，多个try-excepts 捕捉ZeroDivisionError 有点多余。

那么在不通过数据集进行多次循环的情况下获取真/假阳性/阴性计数的 Python 方法是什么？

如何在没有多个 try-excepts 的情况下以 Python 方式捕获 ZeroDivisionError？

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我还可以执行以下操作来计算一个循环中的真/假阳性/阴性，但是是否有没有多个 if 的替代方法？：

for p,g in zip(predicted, gold):
    if p==1 and g==1:
        true_pos+=1
    if p==0 and g==0:
        true_neg+=1
    if p==1 and g==0:
        false_pos+=1
    if p==0 and g==1:
        false_neg+=1

Answer 1

这是bitarray 包的一个非常自然的用例。

import bitarray as bt

tp = (bt.bitarray(p) & bt.bitarray(g)).count()
tn = (~bt.bitarray(p) & ~bt.bitarray(g)).count()
fp = (bt.bitarray(p) & ~bt.bitarray(g)).count()
fn = (~bt.bitarray(p) & bt.bitarray(g)).count()

有一些类型转换开销，但在那之后，按位运算要快得多。

对于 100 个实例，我的 PC 上的 timeit 为您的方法提供 0.036，在 1000 次通过时使用 bitarray 为 0.017。对于 1000 个实例，它达到 0.291 和 0.093。对于 10000、3.177 和 0.863。你明白了。

它可以很好地扩展，不使用循环，并且不必在zip 中存储构建临时元组列表的大型中间表示。

Answer 2

根据您的需要，有几个库可以计算精度、召回率、F-score 等。我使用的一个是scikit-learn。假设您已经将lists 的实际值和预测值对齐，那么它就像...

from sklearn.metrics import precision_recall_fscore_support as pr
bPrecis, bRecall, bFscore, bSupport = pr(gold, predicted, average='binary')

使用这个库的一个优点是不同风格的指标（例如微平均、宏观平均、加权、二进制等）开箱即用。

Answer 3

获取真/假计数的pythonic方法是什么 没有通过数据集的多个循环的正面/负面？

我会在最后使用collections.Counter，大致就是你对所有ifs 所做的（你应该使用elifs，因为你的条件是互斥的）：

counts = Counter(zip(predicted, gold))

然后例如true_pos = counts[1, 1].

如何在没有倍数的情况下以 Python 方式捕获 ZeroDivisionError 尝试例外？

首先，您应该（几乎）永远不要使用裸露的except:。如果您正在捕捉ZeroDivisionErrors，请写except ZeroDivisionError。您还可以考虑使用"look before you leap" 方法，在尝试除法之前检查分母是否为0，例如

accuracy = (true_pos + true_neg) / float(len(gold)) if gold else 0