如何使用神经网络包预测新病例

Question

使用 RGUI。我有一个名为 Data 的数据集。我感兴趣的响应变量包含在Data 的第一列中。

我有 Data 的训练集，称为 DataTrain 和 DataTest。

通过DataTrain，我使用包和函数neuralnet 训练了一个神经网络模型（称为DataNN）。

> DataNN = neuralnet(DataTrain[,1] ~ DataTrain[,2] + DataTrain[,3], hidden = 1,
    data = DataTrain) 

有人知道如何使用测试集 (DataTest) 在此模型上创建预测吗？

通常（对于其他型号）我会为此使用predict()。例如

> DataPred = predict(DataNN, DataTest)

但是当为neuralnet 执行此操作时，我得到：

> DataPred = predict(DataNN, DataTest)

Error in UseMethod("predict") : 
no applicable method for 'predict' applied to an object of class "nn"  

显然我不能在这个模型上运行predict()。有谁知道任何替代方案？

我查看了neuralnet 的帮助，在documentation 的第12 页找到了一个名为prediction 的方法。我认为这根本不是我想要的，或者至少我不知道如何将它应用到我的Data。

任何帮助将不胜感激（如果有任何解决方案的话）。

Answer 1

compute 方法可以满足您的需求，我从帮助文件中复制了这个示例并添加了一些 cmets：

 # Make Some Training Data
 Var1 <- runif(50, 0, 100) 
 # create a vector of 50 random values, min 0, max 100, uniformly distributed
 sqrt.data <- data.frame(Var1, Sqrt=sqrt(Var1)) 
 # create a dataframe with two columns, with Var1 as the first column
 # and square root of Var1 as the second column

 # Train the neural net
 print(net.sqrt <- neuralnet(Sqrt~Var1,  sqrt.data, hidden=10, threshold=0.01))
 # train a neural net, try and predict the Sqrt values based on Var1 values
 # 10 hidden nodes

 # Compute or predict for test data, (1:10)^2
 compute(net.sqrt, as.data.frame((1:10)^2))$net.result
 # What the above is doing is using the neural net trained (net.sqrt), 
 # if we have a vector of 1^2, 2^2, 3^2 ... 10 ^2 (i.e. 1, 4, 9, 16, 25 ... 100), 
 # what would net.sqrt produce?

 Output:
 $net.result
             [,1]
 [1,] 1.110635110
 [2,] 1.979895765
 [3,] 3.013604598
 [4,] 3.987401275
 [5,] 5.004621316
 [6,] 5.999245742
 [7,] 6.989198741
 [8,] 8.007833571
 [9,] 9.016971015
[10,] 9.944642147
# The first row corresponds to the square root of 1, second row is square root
# of 2 and so on. . . So from that you can see that net.sqrt is actually 
# pretty close
# Note: Your results may vary since the values of Var1 is generated randomly.

Answer 2

您应该使用神经网络的预测版本，即

DataPred <- compute(DataNN, DataTest)

如果您使用 dplyr 进行任何操作，那么您需要专门声明库，然后像这样声明函数名称

DataPred <- neuralnet::compute(DataNN, DataTest)

顺便说一句，在为变量赋值时从不使用等号，不幸的是，这是不好的做法。

Answer 3

答案是计算(nn, test)

Answer 4

预测函数是prediction，而不是predict。

所以试试DataPred = prediction(DataNN, DataTest) 而不是DataPred = predict(DataNN, DataTest)。