一个绘图中的多条 ROC 曲线 ROCR答案

【问题标题】：Multiple ROC curves in one plot ROCR一个绘图中的多条 ROC 曲线 ROCR
【发布时间】：2012-12-14 15:35:41
【问题描述】：

是否可以使用 ROCR 包在同一图中绘制不同分类器的 roc 曲线？我试过了：

>plot(perf.neuralNet, colorize=TRUE)
>lines(perf.randomForest)

但我明白了：

错误 en as.double(y) ：无法将类型“S4”强制为“double”类型的向量

谢谢！

【问题讨论】：

标签： r plot roc

【解决方案1】：

R 具有在一个窗口中绘制多个绘图的功能。如果软件包不支持一个窗口中的多个绘图，您可以使用 R 的标准仪器解决问题。其他方式：Example of several ROCs 带有此脚本的文章：An example of ROC curves plotting with ROCR

【讨论】：

谢谢！唯一的问题是这个解决方案似乎是针对交叉验证数据的，所以不可能例如添加一个图例来区分哪条曲线属于哪个分类器。在同一个窗口中绘制多个绘图的工具有哪些？
您可以使用函数 subplot 或查看此文档：[链接]statmethods.net/advgraphs/layout.html

【解决方案2】：

您的lines 方法的问题在于ROCR 包中定义的performance 类对象没有通用S4 行函数。但是您可以像使用额外的 add = TRUE 参数一样使用通用绘图函数。例如这部分来自?plot.performance的示例页面：

library(ROCR)
data(ROCR.simple)
pred <- prediction( ROCR.simple$predictions, ROCR.simple$labels )
pred2 <- prediction(abs(ROCR.simple$predictions + 
                        rnorm(length(ROCR.simple$predictions), 0, 0.1)), 
        ROCR.simple$labels)
perf <- performance( pred, "tpr", "fpr" )
perf2 <- performance(pred2, "tpr", "fpr")
plot( perf, colorize = TRUE)
plot(perf2, add = TRUE, colorize = TRUE)

或者，您可以将所有预测存储在一个矩阵中，然后将所有后续步骤合二为一：

preds <- cbind(p1 = ROCR.simple$predictions, 
                p2 = abs(ROCR.simple$predictions + 
                rnorm(length(ROCR.simple$predictions), 0, 0.1)))

pred.mat <- prediction(preds, labels = matrix(ROCR.simple$labels, 
                nrow = length(ROCR.simple$labels), ncol = 2) )

perf.mat <- performance(pred.mat, "tpr", "fpr")
plot(perf.mat, colorize = TRUE)

顺便说一句，如果您出于某种原因真的想使用lines 来绘制连续的 ROC 曲线，您将不得不这样做。像这样：

plot(perf) 
lines(perf2@x.values[[1]], perf2@y.values[[1]], col = 2)

【讨论】：

太棒了！正是我想要的！

【解决方案3】：

呼应@adibender，并添加评论：该示例不包括如何使用第二种（一次全部绘制）方法为每条曲线设置单独的颜色。在这种情况下，将 col 作为列表传递：

library(ROCR)
data(ROCR.hiv)
x   <- prediction(ROCR.hiv$hiv.nn$predictions, ROCR.hiv$hiv.nn$labels)
ROC <- performance(x, "tpr", "fpr")
plot(ROC, col = as.list(1:10))

【讨论】：