【问题标题】:sklearn PCA not workingsklearn PCA 不工作
【发布时间】:2015-09-27 00:33:07
【问题描述】:
我一直在玩 sklearn PCA,它的行为很奇怪。
from sklearn.decomposition import PCA
import numpy as np
identity = np.identity(10)
pca = PCA(n_components=10)
augmented_identity = pca.fit_transform(identity)
np.linalg.norm(identity - augmented_identity)
4.5997749080745738
请注意,我将维数设置为 10。范数不应该是 0 吗?
任何关于为什么不这样做的见解将不胜感激。
【问题讨论】:
标签:
python
numpy
scikit-learn
pca
【解决方案1】:
虽然 PCA 基于协方差矩阵计算正交分量,但 sklearn 中 PCA 的输入是数据矩阵,而不是协方差/相关矩阵。
import numpy as np
from sklearn.decomposition import PCA
# gaussian random variable, 10-dimension, identity cov mat
X = np.random.randn(100000, 10)
pca = PCA(n_components=10)
X_transformed = pca.fit_transform(X)
np.linalg.norm(np.cov(X.T) - np.cov(X_transformed.T))
Out[219]: 0.044691263454134933