【发布时间】:2017-01-08 16:56:30
【问题描述】:
KMeans 的training 有几个参数,初始化模式默认为kmeans||。问题是它快速前进(不到 10 分钟)到前 13 个阶段,但随后完全挂起,没有产生错误!
Minimal Example 重现问题(如果我使用 1000 点或随机初始化它将成功):
from pyspark.context import SparkContext
from pyspark.mllib.clustering import KMeans
from pyspark.mllib.random import RandomRDDs
if __name__ == "__main__":
sc = SparkContext(appName='kmeansMinimalExample')
# same with 10000 points
data = RandomRDDs.uniformVectorRDD(sc, 10000000, 64)
C = KMeans.train(data, 8192, maxIterations=10)
sc.stop()
作业什么都不做(它没有成功、失败或进展..),如下所示。 Executors 选项卡中没有活动/失败的任务。 Stdout 和 Stderr Logs 没有什么特别有趣的东西:
如果我使用k=81,而不是8192,它会成功:
注意takeSample()、should not be an issue的两次调用,因为在随机初始化的情况下被调用了两次。
那么,发生了什么? Spark 的 Kmeans 无法扩展吗?有人知道吗?你能复制吗?
如果是内存问题,I would get warnings and errors, as I had been before。
注意:placeybordeaux 的 cmets 是基于 client 模式 下作业的执行,其中驱动程序的配置无效,导致退出代码 143 等(请参阅编辑历史记录),而不是集群模式,在根本没有报告错误的地方,应用程序只是挂起。
从 zero323:Why is Spark Mllib KMeans algorithm extremely slow? 相关,但我认为他见证了一些进展,而我的挂起,我确实发表了评论...
【问题讨论】:
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退出代码 143 表示容器因超出为作业分配的内存而被杀死。每个容器为堆大小分配了多少 RAM?你能增加这个吗?
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迈克尔 1.6.2,更新!你说的其他分类器是什么意思?我只关心kmeans。 @placeybordeaux 确实如此。我想知道,在驱动程序或执行程序中?或两者?但是,请注意,这些消息似乎来自已完成,而不是失败的阶段。但是,我会尝试增加它以查看会发生什么...如果您发现这个问题很有趣,请大家投票,以引起更多关注并解开谜团! :)
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可能没有一个简单的答案,您有两个主要因素会影响需要多少内存:数据点的数量和数据的维度。你能减少其中一个并获得一致的结果吗?或者增加每台机器可用的 RAM。您可能还想尝试减少执行程序上的核心数量。如果由于 GC 开销限制而导致失败,那么用更少的内存执行更多任务将无济于事。
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@placeybordeaux 我无法减少#poitns,但我确实执行了降维,64 维听起来已经太低了。那么,您建议我尝试哪种配置?我的问题中有标志.. :)
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@Michael 我确实更新了我的问题,检查一下!
标签: python apache-spark k-means apache-spark-mllib bigdata