看似简单的 rpubchem 交互功能会产生错误答案

【问题标题】：seeming simple rpubchem interactive function produces error看似简单的 rpubchem 交互功能会产生错误
【发布时间】：2016-08-23 21:55:22
【问题描述】：

以下 R 代码行以斜体显示错误。这似乎是一个 rpubchem 错误，除非我在做一些愚蠢的事情：

    require(rpubchem);
    get.aid.by.cid(614467, type="raw")

输出：

***Warning messages:
1: In readLines(icon, n = 100) :
  seek on a gzfile connection returned an internal error
2: In readLines(icon, n = 100) :
  seek on a gzfile connection returned an internal error
3: In file.remove(iname) :
  cannot remove file 'C:\Users\bkoch\AppData\Local\Temp\RtmpSs77GM\abycbdc276782.gz', reason 'Permission denied'***

有人知道这里发生了什么吗？

【问题讨论】：

这不是错误信息。这是一条警告消息，与错误消息不同。错误表示您的命令未成功应用。另一方面，警告表明该命令已执行（但有警告）

标签： r pubchem

【解决方案1】：

在警告提到的文件夹中是通过此包提取数据期间创建的临时文件。警告中提到的文件名存在，但缺少 .gz 扩展名，这可能是问题的一部分。

我通过运行您的代码并检查文件验证了这一点。显然这个问题是一个小错误，我建议在 GitHub 上提交错误报告。

但是请注意，这只是一个警告而不是错误，并且该功能似乎仍然有效。

【讨论】：

感谢两位的澄清。