Python没有安装sklearn

Question

我正在使用 ubuntu 14。我已经下载了 sklearn 的 dpkg 包并将其解压缩。我尝试运行sudo python setup.py install但它似乎陷入了循环

    compiling C++ sources
C compiler: c++ -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -fPIC

creating build/temp.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/src
compile options: '-Isklearn/utils/src -I/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include -I/usr/include/python2.7 -c'
c++: sklearn/utils/src/MurmurHash3.cpp
c++ -pthread -shared -Wl,-O1 -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security build/temp.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/murmurhash.o build/temp.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/src/MurmurHash3.o -Lbuild/temp.linux-x86_64-2.7 -o build/lib.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/murmurhash.so
building 'sklearn.utils.lgamma' extension
compiling C sources
C compiler: x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC

compile options: '-Isklearn/utils/src -I/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include -I/usr/include/python2.7 -c'
x86_64-linux-gnu-gcc: sklearn/utils/lgamma.c
x86_64-linux-gnu-gcc: sklearn/utils/src/gamma.c
x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -shared -Wl,-O1 -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security build/temp.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/lgamma.o build/temp.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/src/gamma.o -Lbuild/temp.linux-x86_64-2.7 -lm -o build/lib.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/lgamma.so
building 'sklearn.utils.graph_shortest_path' extension
compiling C sources
C compiler: x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC

compile options: '-I/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include -I/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include -I/usr/include/python2.7 -c'
x86_64-linux-gnu-gcc: sklearn/utils/graph_shortest_path.c
In file included from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/ndarraytypes.h:1761:0,
                 from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/ndarrayobject.h:17,
                 from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/arrayobject.h:4,
                 from sklearn/utils/graph_shortest_path.c:256:
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/npy_1_7_deprecated_api.h:15:2: warning: #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by " "#defining NPY_NO_DEPRECATED_API NPY_1_7_API_VERSION" [-Wcpp]
 #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by " \
  ^
In file included from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/ufuncobject.h:327:0,
                 from sklearn/utils/graph_shortest_path.c:257:
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/__ufunc_api.h:241:1: warning: ‘_import_umath’ defined but not used [-Wunused-function]
 _import_umath(void)
 ^
x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -shared -Wl,-O1 -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security build/temp.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/graph_shortest_path.o -Lbuild/temp.linux-x86_64-2.7 -o build/lib.linux-x86_64-2.7/sklearn/utils/graph_shortest_path.so
building 'sklearn.utils.fast_dict' extension
compiling C++ sources
C compiler: c++ -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -fPIC

compile options: '-I/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include -I/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include -I/usr/include/python2.7 -c'
c++: sklearn/utils/fast_dict.cpp
In file included from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/ndarraytypes.h:1761:0,
                 from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/ndarrayobject.h:17,
                 from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/arrayobject.h:4,
                 from sklearn/utils/fast_dict.cpp:320:
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/npy_1_7_deprecated_api.h:15:2: warning: #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by " "#defining NPY_NO_DEPRECATED_API NPY_1_7_API_VERSION" [-Wcpp]
 #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by " \
  ^
sklearn/utils/fast_dict.cpp: In function ‘PyObject* __pyx_pw_7sklearn_5utils_9fast_dict_1argmin(PyObject*, PyObject*)’:
sklearn/utils/fast_dict.cpp:18786:44: warning: ‘__pyx_v_min_key’ may be used uninitialized in this function [-Wmaybe-uninitialized]
             return PyInt_FromLong((long)val);
                                            ^
sklearn/utils/fast_dict.cpp:3316:46: note: ‘__pyx_v_min_key’ was declared here
   __pyx_t_7sklearn_5utils_9fast_dict_ITYPE_t __pyx_v_min_key;
                                              ^
In file included from /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/ufuncobject.h:327:0,
                 from sklearn/utils/fast_dict.cpp:321:
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/__ufunc_api.h: At global scope:
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy/__ufunc_api.h:241:1: warning: ‘int _import_umath()’ defined but not used [-Wunused-function]
 _import_umath(void)
 ^

.. 并继续这样。

我已经安装了numpy，但是我是通过ubuntu的软件中心安装的。当我尝试在 python 中导入 sklearn 时，我得到了

from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier Traceback（大多数 最近通话最后一次）：文件“”，第 1 行，在文件中 “sklearn/init.py”，第 37 行，在 从 。导入 check_build 文件“sklearn/__check_build/__init.py”，第 46 行，在 raise_build_error(e) 文件“sklearn/check_build/__init.py”，第 41 行，在 raise_build_error %s""" % (e, local_dir, ''.join(dir_content).strip(), msg)) ImportError: No module named _check_build _____________________________________________________________ sklearn/check_build 的内容：setup.py
__init.py _check_build.pyx _check_build.c setup.pyc init.pyc _____________________________________________________________ scikit-learn 似乎没有正确构建。

如果你已经从源代码安装了 scikit-learn，请不要忘记 在使用之前构建包：运行python setup.py install 或 make 在源目录中。

如果您使用过安装程序，请检查它是否适合您的 Python 版本、您的操作系统和您的平台。

我不知道 sklearn/check_build 的位置。

我在 /usr/lib/python2.7/dist-packages 中的文件夹是空的，但我可以在 python 中导入 numpy。就像我说的，我使用 ubuntu 软件中心安装了 numpy，但没有安装我现在后悔的 sklearn。

Answer 1

我建议使用 Anaconda 包安装 sklearn 和所有依赖项：https://www.continuum.io/downloads#_unix

它将与 numpy 和其他软件包一起安装，完整列表在这里：http://docs.continuum.io/anaconda/pkg-docs

Answer 2

如果你想让你的包管理器处理所有事情，这通常是可行的，尽管你不一定使用最新版本

否则做一些类似的事情

sudo apt-get install build-essential gcc g++ python-dev python3-dev python-scipy python3-scipy

并尝试再次安装/编译。编译 python 扩展模块依赖于有一个工作编译环境，以及 python 的扩展或开发头文件。我不确定这些依赖项是否 100% 完全适合 Ubuntu b/c 我最近一直在使用更多的 openSUSE，但是如果我打错了，apt-cache search 会为您提供正确的命名

Answer 3

处理环境问题的一种新方法是使用 docker 映像来处理它。这允许任何开发人员在一分钟内在任何服务器中重新创建环境。您可以从here 拉取图像。

这也可以使用 datmo CLI 工具非常轻松地执行。我们自己也遇到了这些问题，并决定建造它。

编辑：您可以按如下方式安装，

apt-get update; \
apt-get install -y python python-pip \
                    python-numpy \
                    python-scipy \
                    build-essential \
                    python-dev \
                    python-setuptools \
                    libatlas-dev \
                    libatlas3gf-base

update-alternatives --set libblas.so.3 /usr/lib/atlas-base/atlas/libblas.so.3; update-alternatives --set liblapack.so.3 /usr/lib/atlas-base/atlas/liblapack.so.3

pip install -U scikit-learn

免责声明：我在Datmo工作