带有作业数组的 PBS 延迟执行答案

【问题标题】：PBS deferred execution with job array带有作业数组的 PBS 延迟执行
【发布时间】：2014-10-09 21:46:03
【问题描述】：

我正在尝试编写一个作业数组，以便各个作业在稍微不同的时间点开始。（因为我调用的程序使用最接近秒的时间作为随机种子，如果同时提交所有作业，它将生成相同的结果。）

这是我正在使用的指令：

#!/bin/bash
#PBS -N test
#PBS -t 1-10                   # Job array
#PBS -a hhmm.ss                # Deferred execution

echo Time is `date` >> test.out

但我希望 -a 被隔开。我正在考虑编写一个小子程序，以该格式打印出随机数并将其提供给 -a，但我不知道如何使 -a 采用变量的选项。

欢迎任何其他方面的解决方案，唯一的要求是作业数组中的作业以随机时间间隔开始。

希望这是有道理的，否则我很乐意澄清。

【问题讨论】：

如果这是 TORQUE 2.4 或更高版本，您可以通过将 #PBS -t 1-10 更改为 #PBS -t 1-10%1 来强制所有作业都不会同时执行。如果您可以编辑程序，我强烈建议您使用不同的随机种子，因为有很多更好的方法可以做到这一点。

标签： job-scheduling pbs deferred-execution

【解决方案1】：

#!/bin/bash
#PBS -N test
#PBS -t 1-10                   # Job array

sleep `expr $RANDOM % 60`     
echo Time is `date` >> test.out

有朋友建议在脚本开头使用wait或sleep，让job在重新开始前等待。这个 expr $RANDOM % 60 将它们隔开几秒钟（小于 60）。请注意，您不再需要延迟执行（没有 -a 指令）。

【讨论】：