PBS 调度程序为 3 个处理器的 MPI 程序分配相同的处理器

Question

我正在一个有 8 个节点的集群上进行 MPI 编程，每个节点都有一个英特尔至强六核处理器。我的 mpi 代码需要三个处理器。

我使用 qsub 提交作业。当我使用“qstat -n”检查作业正在运行的处理器时，它会显示类似 cn004/0*3 的内容。

这是否意味着它只在一个处理器上运行？？

因为它没有比我使用单个处理器时更快（这是两种情况下域大小相同的情况）

我用来提交的脚本如下

#! /bin/bash
#PBS -o logfile.log
#PBS -e errorfile.err
#PBS -l cput=40:00:00
#PBS -lselect=1:ncpus=3:ngpus=3
#PBS -lplace=excl
cat $PBS_NODEFILE
cd $PBS_O_WORKDIR
mpicc -g -W -c -I /usr/local/cuda/include mpi1.c
mpicc -g -W mpi1.o -L /usr/local/cuda/lib64 -lOpenCL
mpirun -np 3 ./a.out

Answer 1

“qstat -n”它表示类似 cn004/0*3。

问：这是否意味着它只在一个处理器上运行？？

简短的回答是“不”。这并不意味着它在一个处理器上运行。 “cn004/0*3”应解释为“作业分配了三个 cpu 核心。如果我们将核心编号从 0 到 5，那么分配的核心将具有编号 0、1 和 2”。

如果另一个作业要在节点上运行，它将收到接下来的三个连续数字“3,4 和 5”。在qstat -n 输出中，这看起来像“cn004/3*3”。

您使用指令place=excl 来确保其他作业不会获得该节点，因此基本上所有六个核心都可用。

现在回答你的第二个问题：

问：它没有比我使用单处理器时快

为了回答这个问题，我们需要知道算法是否正确并行化。