使用扫描仪从输入文件中读取两行

Question

您好，我在暑假上编程课，需要创建一个从文件读取输入的程序。输入文件包括 DNA 序列 ATCGAGG 等，文件的第一行说明需要比较多少对序列。其余的是成对的序列。在课堂上，我们使用 Scanner 方法从文件中输入行，（我阅读了有关 bufferedReader 的内容，但我们没有在课堂上介绍它，所以不熟悉它）但是我不知道如何编写代码来比较两行Scanner 方法同时进行。

我的尝试：

public static void main (String [] args) throws IOException 
{
File inFile = new File ("dna.txt");

Scanner sc = new Scanner (inFile);
while (sc.hasNextLine())
{
  int pairs = sc.nextLine();
  String DNA1 = sc.nextLine();
  String DNA2 = sc.nextLine();
  comparison(DNA1,DNA2);
}
sc.close();
}

如果它们有共同的任何共同字符，比较方法将采用一对序列并输出。另外，我将如何继续输入下一对，任何见解都会有所帮助.. 只是被难住了，谷歌让我更加困惑。谢谢！

编辑：

这是示例输入

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atgcatgcatgc
AtgcgAtgc
GGcaAtt
ggcaatt
GcT
gatt
aaaaaGTCAcccctccccc
GTCAaaaaccccgccccc
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
gctagtacACCT
gctattacGcct

Answer 1

首先你为什么这样做：

while (sc.hasNextLine())
{
  int pairs = sc.nextLine();

虽然你只在一行中有对，而不是对和两行输入，但只有几行？从while循环中移动读取对并将其解析为int，然后没关系，但如果您知道有多少行，您可以使用它来停止读取行。

第二：

throws IOException

可能无关紧要，但是，如果您不关心异常，您真的不知道如何尝试捕获并假设跳过？

比较，如果您读取字符串，则字符串具有“等于”方法，您可以使用该方法比较两个字符串。

谷歌不会帮你解决这些问题，你只是不知道这一切，但如果你想知道然后搜索基本的东西，比如输入谷歌“字符串比较 java”，不要认为你能找到解决方案在谷歌中输入“使用扫描仪从输入文件中读取两行”，您必须逐步将问题切割成更小的部分，这就是软件开发人员的做法。

好的，我有 progz 不知何故为我工作，只是找到有东西的行，然后即使我有部分也打印出来，所以对于这样的事情来说，蛮力是可以的：

import java.io.File;
import java.io.IOException;
import java.util.Scanner;

public class program
{

public static void main (String [] args) throws IOException 
{
File inFile = new File ("c:\\dna.txt");

Scanner sc = new Scanner (inFile);
int pairs = Integer.parseInt(sc.nextLine());
for (int i = 0; i< pairs-1; i++)
{
    //ok we have 7 pairs so we do not compare everything that is one under another
  String DNA1 = sc.nextLine();
  String DNA2 = sc.nextLine();
  Boolean compareResult = comparison(DNA1,DNA2);

  if (compareResult){
    System.out.println("found the match in:" + DNA1 + " and " + DNA2)  ;
  }
}
sc.close();
}


public static Boolean comparison(String dna1, String dna2){

    Boolean contains = false;
    for (int i = 0; i< dna1.length(); i++)
    {
        if (dna2.contains(dna1.subSequence(0, i)))
        {
            contains = true;
            break;
        }
        if (dna2.contains(dna1.subSequence(dna1.length()-i,dna1.length()-1 )))
        {
            contains = true;
            break;
        }       
    }

    return contains;    
}

}