【发布时间】:2015-09-16 13:31:53
【问题描述】:
考虑 Julia 中的以下 4 个函数:它们都选择/计算矩阵 A 的随机列,并将该列的常数乘以向量 z。
slow1 和 fast1 之间的区别在于 z 的更新方式,slow2 和 fast2 也是如此。
1 函数和 2 函数之间的区别在于矩阵 A 是传递给函数还是动态计算。
奇怪的是,对于 1 函数,fast1 更快(正如我在使用 BLAS 而不是 += 时所期望的那样),但对于 2 函数 slow1 更快。
在这台计算机上,我得到以下时间(每个函数的第二次运行):
@time slow1(A, z, 10000);
0.172560 seconds (110.01 k allocations: 940.102 MB, 12.98% gc time)
@time fast1(A, z, 10000);
0.142748 seconds (50.07 k allocations: 313.577 MB, 4.56% gc time)
@time slow2(complex(float(x)), complex(float(y)), z, 10000);
2.265950 seconds (120.01 k allocations: 1.529 GB, 1.20% gc time)
@time fast2(complex(float(x)), complex(float(y)), z, 10000);
4.351953 seconds (60.01 k allocations: 939.410 MB, 0.43% gc time)
对这种行为有解释吗?还有一种方法可以让 BLAS 比 += 更快?
M = 2^10
x = [-M:M-1;]
N = 2^9
y = [-N:N-1;]
A = cis( -2*pi*x*y' )
z = rand(2*M) + rand(2*M)*im
function slow1(A::Matrix{Complex{Float64}}, z::Vector{Complex{Float64}}, maxiter::Int)
S = [1:size(A,2);]
for iter = 1:maxiter
idx = rand(S)
col = A[:,idx]
a = rand()
z += a*col
end
end
function fast1(A::Matrix{Complex{Float64}}, z::Vector{Complex{Float64}}, maxiter::Int)
S = [1:size(A,2);]
for iter = 1:maxiter
idx = rand(S)
col = A[:,idx]
a = rand()
BLAS.axpy!(a, col, z)
end
end
function slow2(x::Vector{Complex{Float64}}, y::Vector{Complex{Float64}}, z::Vector{Complex{Float64}}, maxiter::Int)
S = [1:length(y);]
for iter = 1:maxiter
idx = rand(S)
col = cis( -2*pi*x*y[idx] )
a = rand()
z += a*col
end
end
function fast2(x::Vector{Complex{Float64}}, y::Vector{Complex{Float64}}, z::Vector{Complex{Float64}}, maxiter::Int)
S = [1:length(y);]
for iter = 1:maxiter
idx = rand(S)
col = cis( -2*pi*x*y[idx] )
a = rand()
BLAS.axpy!(a, col, z)
end
end
更新:
剖析slow2:
2260 task.jl; anonymous; line: 92
2260 REPL.jl; eval_user_input; line: 63
2260 profile.jl; anonymous; line: 16
2175 /tmp/axpy.jl; slow2; line: 37
10 arraymath.jl; .*; line: 118
33 arraymath.jl; .*; line: 120
5 arraymath.jl; .*; line: 125
46 arraymath.jl; .*; line: 127
3 complex.jl; cis; line: 286
3 complex.jl; cis; line: 287
2066 operators.jl; cis; line: 374
72 complex.jl; cis; line: 286
1914 complex.jl; cis; line: 287
1 /tmp/axpy.jl; slow2; line: 38
84 /tmp/axpy.jl; slow2; line: 39
5 arraymath.jl; +; line: 96
39 arraymath.jl; +; line: 98
6 arraymath.jl; .*; line: 118
34 arraymath.jl; .*; line: 120
剖析fast2:
4288 task.jl; anonymous; line: 92
4288 REPL.jl; eval_user_input; line: 63
4288 profile.jl; anonymous; line: 16
1 /tmp/axpy.jl; fast2; line: 47
1 random.jl; rand; line: 214
3537 /tmp/axpy.jl; fast2; line: 48
26 arraymath.jl; .*; line: 118
44 arraymath.jl; .*; line: 120
1 arraymath.jl; .*; line: 122
4 arraymath.jl; .*; line: 125
53 arraymath.jl; .*; line: 127
7 complex.jl; cis; line: 286
3399 operators.jl; cis; line: 374
116 complex.jl; cis; line: 286
3108 complex.jl; cis; line: 287
2 /tmp/axpy.jl; fast2; line: 49
748 /tmp/axpy.jl; fast2; line: 50
748 linalg/blas.jl; axpy!; line: 231
奇怪的是,col 的计算时间不同,尽管到目前为止功能相同。
但是+= 还是比axpy! 快。
【问题讨论】:
-
不确定发生了什么,但我没有在我的计算机上看到相同的行为。您是否尝试过分析?
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感谢您试用代码!奇怪的是你没有看到类似的行为。我已经用分析结果更新了帖子。
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很奇怪!更新到 Julia v0.4-rc1 后在另一台计算机上运行代码,现在
fast?函数都比它们的slow等效函数快...