无法安装 scikits.sparse - Clang 错误答案

【问题标题】：Failing to install scikits.sparse - Clang error无法安装 scikits.sparse - Clang 错误
【发布时间】：2013-10-18 18:49:20
【问题描述】：

我在使用 django 时遇到以下错误：

Exception Type: ImportError
Exception Value:    No module named sparse

导入错误来自：

from sklearn.svm.sparse import LinearSVC
from nltk.classify.scikitlearn import SklearnClassifier

为了解决这个问题，我尝试通过以下方式为 scikit-learn 安装稀疏模块：

sudo easy_install scikits.sparse

但我收到此错误：

no previously-included directories found matching 'doc/_build'
warning: no previously-included files matching '*~' found anywhere in distribution
warning: no previously-included files matching '*.so' found anywhere in distribution
warning: no previously-included files matching '*.pyc' found anywhere in distribution
clang: error: no such file or directory: 'scikits/sparse/cholmod.c'
clang: error: no input files
error: Setup script exited with error: command 'clang' failed with exit status 1

我该如何解决这个问题？

谢谢。

【问题讨论】：

标签： python scikit-learn installation clang sparse-matrix

【解决方案1】：

改变

from sklearn.svm.sparse import LinearSVC

到

from sklearn.svm import LinearSVC

忘记scikits.sparse，它与 scikit-learn 无关。 sklearn.svm.sparse 模块在几个版本前已从 scikit-learn 中删除。

【讨论】：

【解决方案2】：

适用于对安装 scikits.sparse 特别感兴趣的任何人。我在 Mac OS X 10.9 中遇到了麻烦。问题与 setuptools 根据您是否安装了 Cython 和 Pyrex 做出假设有关。

一个解决方案，当然不是最好的解决方案（对我有用）是安装 Pyrex。对于 macports 用户：

sudo port install py27-pyrex

安装 SparseSuite。

编辑 setup.py 文件，使 ext_modules 的值如下：

ext_modules = [
    Extension("scikits.sparse.cholmod",
              ["scikits/sparse/cholmod.pyx"],
              libraries=["cholmod"],
              include_dirs=[np.get_include(), "path/to/sparsesuite/include"],
              library_dirs=["path/to/sparsesuite/lib"]
              ),
    ]

对我来说，SparseSuite 的包含和库目录分别是 usr/local/include 和 /usr/local/lib。

在 scikits/sparse/cholmod.pyx 文件中编辑以下行：

cdef extern from "sparsesuite/cholmod.h":

到

cdef extern from "cholmod.h":

然后尝试再次安装 scikits.sparse。应该可以。

【讨论】：