计算时bash中的变量错误

Question

我将管道的输出分配给一个变量，但是当我尝试使用该变量进行数学运算时，它不允许我：

%%bash
cd /data/ref/
grep -v ">" EN | wc -c > ref
cat ref
cd /example/
grep -v ">" SR | wc -l > sample
cat sample

echo $((x= cat sample, y= cat ref, u=x/y, z=u*100))

我收到此错误：

41858
38986
bash: line 7: x= cat sample, y= cat ref, u=x/y, z=u*100: syntax error in expression (error token is "sample, y= cat ref, u=x/y, z=u*100"

Answer 1

您收到该错误是因为您将无效的算术表达式传递到 bash arithetic expansion。这个地方只允许使用算术表达式。你尝试做的看起来像这样：

ref="$(grep -v ">" /data/ref/EN | wc -c)"
sample="$(grep -v ">" /example/SR | wc -l)"

# this is only integer division
#u=$(( sample / ref ))
#z=$(( 100 * u ))

# to do math calculations, you can use bc
u=$(bc <<< "scale=2; $sample/$ref")
z=$(bc <<< "scale=2; 100*$u")

printf "%d, %d, %.2f, %.2f\n" "$ref" "$sample" "$u" "$z"

所以希望你得到这样的输出：

41858, 38986, 0.93, 93.00

注意事项：

• 在执行grep 之前不需要cd，它接受带有目标文件名的完整路径作为参数。所以不用换目录，就可以grep各个位置。

• 为了保存您的命令的输出（这只是一个数字），您不需要将其保存在文件和cat 文件中。只需使用语法var=$( ) 和var 将被分配此command substitution 的输出。

• 请记住，/ 将导致除法 38986/41858 为 0，因为它是整数除法。如果您想使用小数进行数学计算，您可以查看此post，了解如何使用bc 进行计算。

• 要打印任何内容，请使用内置的 shell printf。这里最后两个数字用 2 个小数点格式化。