DICOM 文件信息到 .txt 文件答案

【问题标题】：DICOM file info to .txt fileDICOM 文件信息到 .txt 文件
【发布时间】：2016-01-12 17:23:13
【问题描述】：

我有一个包含放射治疗剂量分布的 DICOM 文件。在 MatLab 中计算各种事物需要这种剂量分布。但不知何故，MatLab 无法读取这些特定文件，我不知道为什么。

我尝试了一些在线程序，实际上可以读取它们，但是我无法导出包含剂量分布的 3D 矩阵，然后我可以将其加载到 MatLab 中。

我发现的唯一的东西是一个程序，它一次为一个切片提供一个包含三列（x 位置、y 位置和亮度）的 txt 文件。 Ofc，由此我可以创建我正在寻找的内容，但是每次为每个患者导出 100-1500 个切片以导出单个 txt 文件非常耗时。

所以我想知道是否有人知道可以轻松做到这一点的程序或其他东西？

【问题讨论】：

如果是二进制文件 fread 应该可以解决问题
您应该使用 matlab 和 DICOM 文件解决您的问题，而不是搜索其他程序。读取文件有什么问题？如果一切都失败了，转换成文本可能是最糟糕的选择，对于图像，你必须使用二进制格式，否则文件会变得很大。
@Daniel 说实话，是我的同事使用 MatLab 来做这件事，但无法让它工作。他只是说他无法正确读取它，如果他尝试访问剂量，则会得到一个空矩阵。它是这样的文件：1drv.ms/1SMJrDE 我不知道他是否做错了什么，或者这是一个奇怪的 DICOM。
你能提供一些代码和错误信息吗？
您能告诉我们您尝试了什么，当您说“MatLab 无法读取这些特定文件”时，您得到了什么结果？ MATLAB 具有相对不错的 DICOM 支持，从 dicomread 开始。有一整页的DICOM文档here。

标签： matlab text dicom

【解决方案1】：

您绝对可以使用内置的 MATLAB 函数来处理这个问题。

要获取 DICOM 标头，您需要使用 dicominfo，然后要获取您想要获取的图像数据，您需要使用 dicomread。

使用您提供的示例图像，我能够使用以下内容加载它。

info = dicominfo('rtdose.dcm');  % Unnecessary because you can use dicomread directly on the filename
im = dicomread(info);
size(im)

    512   512   1   118

如您所见，这是一个 4D 矩阵，我假设第 4 维是时间。然后我循环浏览这些图像，发现大多数信号发生在特定时间点之间，我制作了这些图像以灰度显示的 gif 图像（左上角的帧号）。

【讨论】：