【问题标题】:get degree of parent node in a graph igraph获取图表 igraph 中父节点的度数
【发布时间】:2016-03-18 16:07:45
【问题描述】:

我有一个图表,我想为每个节点计算其父节点的度数。

这里以图为例,

在本例中,node-9 的度数为 9,node-19 有 5 个连接,node-3 有 4 个连接;而对于节点 5,它将是 3,因为它的父节点 13 有 3 个连接。

我想计算从一个节点(例如 node-19)开始的度数,并根据节点 2 的父节点计算度数,距离节点 19 3 步。

我正在考虑使用函数ego,但它也给了我第 2 步和第 3 步中父母的父母。

有什么帮助吗?

【问题讨论】:

  • 您可能需要将其保存为 png 等图像格式,而不是 pdf。
  • 一个可重现的例子会更好。

标签: r igraph


【解决方案1】:

这是来自 igraph 社区教程的图表:

 g <- graph_from_literal(A-B:F:C:E:D, B-A:D:C:E:F:G, C-A:B:F:E:D, D-A:B:C:F:E,
                                          E-D:A:C:B:F:V:W:U, F-H:B:A:C:D:E, G-B:J:K:L:H,
                                         H-F:G:I:J:K:L, I-J:L:H, J-I:G:H:L, K-G:H:L:M,
                                          L-H:G:I:J:K:M, M-K:L:Q:R:S:P:O:N, N-M:Q:R:P:S:O,
                                          O-N:M:P, P-Q:M:N:O:S, Q-M:N:P:V:U:W:R, R-M:N:V:W:Q,
                                          S-N:P:M:U:W:T, T-S:V:W:U, U-E:V:Q:S:W:T,
                                          V-E:U:W:T:R:Q, W-U:E:V:Q:R:S:T)


plot(g, vertex.color = "grey", edge.color = "blue")

degree(g) 为您提供图中每个节点的度数,neighbors(g,1,'A')[[1]] 为您提供距离“A”1 条边的所有邻居。

degree(g)
A B F C E D G V W U H J K L I M Q R S P O N T 
5 6 6 5 8 5 5 6 7 6 6 4 4 6 3 8 7 5 6 5 3 6 4 

neighbors(g,1,'A')[[1]]
+ 6/23 vertices, named:
[1] A B F C E D

我们可以结合归纳:

dist <- 1
pick <- 'A'

 neighbors_w_degree <- degree(g)[neighborhood(g,dist,pick)[[1]]]
 neighbors_w_degree
A B F C E D 
5 6 6 5 8 5 

在您的示例中,我们要排除基节点的度数,因此使用:

sum(neighbors_w_degree[!names(neighbors_w_degree) %in% pick])
[1] 30

在这种情况下是程度:B + C + D + E + F

【讨论】:

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