plot_model 的默认错误间隔是多少？答案

【问题标题】：What are the default error intervals for plot_model?plot_model 的默认错误间隔是多少？
【发布时间】：2021-04-11 18:25:07
【问题描述】：

我正在使用sjPlot::plot_model 绘制lmer 模型。什么是默认误差线？

这是我的模型：

 p <- lmer(dv~iv1+ factor(iv2)+ (1+iv1+factor(iv2)|subject))

这是没有指定误差区间的绘图模型：

p <- plot_model(p3, type="pred", terms=c("iv1", "iv2"), title="Predicted Values")

这是指定 95% CI 的绘图模型：

p <- plot_model(p3, type="pred", terms=c("iv1", "iv2"), ci.lvl=0.95, title="Predicted Values")

最后，这些图表看起来非常相似。我只想确认默认 (1) 错误间隔代表什么，因为我忘了最初指定，如果它们是 95% CI，那么我不必重新制作我为已经进行的几个分析创建的所有图表实施。感谢您的帮助！

【问题讨论】：

plot_model 来自哪个包？帮助文件对 ci.lvl 的默认值有何说明？
这是 ci.lvl 的帮助文件所说的：“数字，置信区间的水平（误差线）。使用 ci.lvl = NA 删除误差线。对于 stanreg-models , ci.lvl 定义了绘制的可信区间的（外部）概率（参见 ci）。默认情况下，stanreg-models 打印有两个区间：“内部”区间，默认为 50%-CI；和“外部”区间，默认为 89%-CI。在这种情况下，ci.lvl 仅影响外部区间。有关详细信息，请参阅 ...-argument 下的 prob.inner 和 prob.outer。”
我没有读过这样描述的CI，所以对我来说有点困惑。这基本上是说这是一个89％的CI吗？ @RichardTelford
加载的包包括：tidyverse、lm4、lmerTest、ggplot2、ggeffects、sjPlot @RichardTelford

标签： r ggplot2 lme4 sjplot

【解决方案1】：

检查帮助文件总是好的。正如您在 cmets @saraconnor 中所写，“默认情况下，stanreg 模型以两个间隔打印：“内部”间隔，默认为 50%-CI；和“外部”间隔，默认为 89%-CI。在这种情况下，ci.lvl 只影响外部区间"

是的，此函数的默认置信区间为 89%。许多图可以包含内部和外部 CI 波段，帮助文件说最外面的波段默认为 ci.lvl=0.89，您必须手动指定为 ci.lvl=0.95 或 prob.outer=0.95，就像您一样。内部带由prob.inner 指定（默认为 0.50，正如您提供的帮助文件文本所建议的那样）。这些数字中的任何一个都可以设置在 0 和 1 之间。

参见 McElreath, R. (2020)。 Statistical rethinking: A Bayesian course with examples in R and Stan。 CRC出版社。关于为什么 89% CI - 扰流板的一种解释，因为它是素数！（仅说明 95 或任何其他值的任意性）。

【讨论】：