【发布时间】:2015-10-05 12:05:48
【问题描述】:
我正在尝试在 R/shiny 中构建一个用于探索性分析的报告系统,并且发现交互式文档功能特别有吸引力。不幸的是,交互式文档模板似乎已经要求您了解输入数据的性质。我想要做的是有一个配置文件,我为各个报告修改,但不理会实际的报告 Rmarkdown 脚本。这是我目前拥有的:
参数.R:
file_directory <- "/ngsdata/intern/projects/Exomes/vcfs/"
files <- c(
"s38499.toprocess.tsv",
"s38626.toprocess.tsv",
"s38600.toprocess.tsv"
)
files <- paste0(file_directory,files)
sampleNames <- c("38499","38626","38600")
我的 Rmd 文件:
checkBoxList <- paste("checkbox",sampleNames,sep="_")
for (i in 1:length(sampleNames)) {
checkboxInput(checkBoxList[i], label = sampleNames[i], value=TRUE)
}
checkboxInput("38499", label = "my label", value=TRUE)
当我在 Rstudio 中单击“运行文档”时,for 循环中的任何复选框都不会显示,但最后一个(“我的标签”)确实会显示。
关于如何根据 parameters.R 文件的内容而不是修改 Rmd 文件来确定复选框数量的任何提示?
【问题讨论】:
标签: r shiny knitr r-markdown