“cacheSweave 不缓存副作用”是什么意思？

Question

我正在使用 cachesweave，但我不认为我了解一切是如何工作的。我试图将代码分成模拟块和绘图块，但有些代码很长，而且是在我开始 sweave 文档之前编写的，所以我改用类似

 <<foo,cache=TRUE>>
 source("mainScript.R")
 @
 <<plot,fig=TRUE>>
 a<- print(str(F1))
 plot(F1)
 @

问题是 mainScript.R 是有点复杂的模拟代码，包括绘图函数等。我在 cacheSweave 小插图中读到“cacheSweave 不缓存副作用”并且绘图没有被缓存，所以我想知道 mainScript.R 中的绘图函数是否影响表达式的评估方式？

这可能是一个显而易见的问题。假设我在上述两个之后还有另一个块。 “foo”和“plot”中表达式的所有结果都可以在这个新块中使用，对吧？例如，

 <<post-chunk>>
 print(a)
 print(str(F1))
 @

Answer 1

请参阅Wikipedia 了解完整说明。 R 中的一些常见副作用包括：print() 对象、绘图、写入文件和加载包。

cacheSweave 包只允许您跳过计算，并且您必须失去所有副作用。正如 Dason 评论的那样，knitr 包在缓存方面更加自然——您在未缓存块中看到的内容将在缓存块中看到。 knitr 中副作用的缓存在网站中的its manual 和cache page 中进行了说明。

顺便说一句，knitr 保持与 Sweave 和 cacheSweave 的兼容性，所以希望您不需要为过渡做任何事情；只需致电library(knitr); knit('file.Rnw')。