如何从python将整数参数传递给R脚本

Question

我有下面发布的 R 代码，我想从 python 代码传递参数n并显示结果。也就是说，如果我通过了 4，那么 16 必须在屏幕上打印出来。 请让我知道如何从 python 将 argumnets 传递给 R-script

R 代码：

Square <- function(n) {
return(n^2)
}

Python 代码：

command ='Rscript'
path2Func1Script ='/var/www/aw/Rcodes/func-1.R'
args = [3]
cmd = [command, path2Func1Script]

output = None
try:
    x = subprocess.call(cmd + args, shell=True)
    print("x: ", x)
except subprocess.CalledProcessError as e:
    output = e.output
    print("output: ", output)

Answer 1

解决方案：

我看到你正在手动执行此操作，我建议你使用为此构建的一个很棒的 python 库，名为rpy2。 Rpy2 提供了很多功能来使用来自 python 本身的 R 库和函数，而无需使用子进程在 python 的命令行参数中手动调用 r 脚本，这不仅使编码更容易，而且更高效。

需要注意的最重要的一点是，要将 python 整数列表解析为 r 函数，您需要将其转换为 r IntVector，就像 robjects.vectors.IntVector() 一样。另外要提到的是，您需要设置 @987654328 @ 环境变量指向你的 R 安装路径，如果你使用的是 windows 的话

首先使用 conda 安装 rpy2（pip 仅适用于带有此软件包的 linux）：

conda install -c conda-forge rpy2

这里是代码python代码：

import rpy2.robjects as robjects


# Defining the R script and loading the instance in Python
r = robjects.r
r['source']('func-1.R')

# Loading the function we have defined in R.
square_func = robjects.globalenv['Square']

# defining the args
args = robjects.vectors.IntVector([3])

#Invoking the R function and getting the result
result_r = square_func(args)

#printing it.
print('x: ' , result_r)

输出：

x: [1] 9