R 上的 IndVal（来自 labdsv 的指标物种）

Question

我已经在 R 上加载了 labdsv 包，我正在尝试运行 indval 如下：https://www.youtube.com/watch?v=mExObdyuVbw

当我输入iva <- indval(A.only, B$Location) 时，根据我的数据名称，我不断收到错误消息：

indval.default(A.only, B$Location) 中的错误： 所有物种必须至少出现在一个地块中

我检查了几次，没有任何数据的物种（全为 0）已从我的表中删除）。

知道导致该错误的原因以及如何处理指标值吗？

Answer 1

我遇到了类似的问题。我首先删除了没有任何内容的物种（列）

mydata2 <- mydata[ , which(!apply(mydata==0,2,all))]

我仍然有同样的错误。问题是某些物种列有 NA，所以我将它们更改为零。

mydata2[is.na(mydata2)] <- 0

之后效果很好。