安装 Scanpy 时如何解决“不兼容的 numba”错误？答案

【问题标题】：How do I solve "incompatible numba" error while installing Scanpy?安装 Scanpy 时如何解决“不兼容的 numba”错误？
【发布时间】：2021-03-21 14:32:11
【问题描述】：

我尝试使用“pip install Scanpy”在 Jupyter 上安装 Scanpy 包，但出现以下错误；

错误：pynndescent 0.5.2 要求 numba>=0.51.2，但您将拥有不兼容的 numba 0.48.0。错误：umap-learn 0.5.1 要求 numba>=0.49，但您将拥有不兼容的 numba 0.48.0

当我尝试单独安装升级版的numba时，出现以下错误；

错误：无法卸载“llvmlite”。这是一个 distutils 安装的项目，因此我们无法准确确定哪些文件属于它，这只会导致部分卸载。

【问题讨论】：

标签： python anaconda scanpy

【解决方案1】：

运行pip install --upgrade numba
运行pip install scanpy

【讨论】：

【解决方案2】：

如果它对您不起作用，您可以尝试使用 pip install -c numba numba=0.51.2.1rc1 安装 RUN pip install llvmlite --ignore 在 pip install numba 之前安装。祝你有美好的一天:)

【讨论】：