如何更改数据框列表中的所有 0

Question

我想在数据帧列表中将所有 0 更改为 0.0001，以避免在获取日志时使用 -Inf。所以按照Replace all 0 values to NA的指示，我把我的函数写成

set_zero_as_value <- function(x, value=0.0001){
    x[x == 0] <- value
}

但是，当我将sapply 用于我的数据sapply(a,set_zero_as_value) 时，结果返回为

   s1    s2 
1e-04 1e-04 

进一步检查列表 a，a 中的 0 完全没有变化。有解决办法吗？

PS：列表a可以创建为

> a = NULL
> a$s1 = rbind(cbind(0,1,2),cbind(3,4,5))
> a$s2 = rbind(cbind(0,1,2),cbind(3,4,5))

Answer 1

在lapply 调用中使用pmax，无需定义set_zero_as_value，因为pmax 可以满足您的需求。假设您的列表是：

list.DF <-list(structure(list(a = c(1L, 2L, 3L, 5L, 1L, 5L, 5L, 3L, 3L, 
0L), b = c(1L, 1L, 4L, 2L, 4L, 2L, 4L, 5L, 2L, 4L), c = c(5L, 
1L, 3L, 0L, 1L, 2L, 0L, 2L, 5L, 2L)), .Names = c("a", "b", "c"
), row.names = c(NA, -10L), class = "data.frame"), structure(list(
    d = c(2L, 3L, 2L, 1L, 4L, 4L, 4L, 0L, 4L, 2L), e = c(4L, 
    3L, 4L, 3L, 3L, 4L, 0L, 2L, 4L, 4L), f = c(2L, 5L, 2L, 1L, 
    0L, 0L, 1L, 3L, 3L, 2L)), .Names = c("d", "e", "f"), row.names = c(NA, 
-10L), class = "data.frame"))

现在应用您想要的转换：

> lapply(list.DF, function(x) sapply(x, pmax, 0.0001))

---

如果您想使用set_zero_as_value 函数，请在其末尾添加return(x)。

set_zero_as_value <- function(x, value=0.0001){
  x[x == 0] <- value
  return(x)
}

lapply(list.DF, function(x) sapply(x, set_zero_as_value))

这将产生与以前相同的结果。