【发布时间】:2019-11-19 13:39:20
【问题描述】:
我尝试将 MuMin-Package 的疏浚函数用于配备 glmmTMB 包的负二项式广义线性混合模型。
由于我的完整模型未能收敛,我尝试了此处描述的解决方法: Dredge with the global model failing to converge
但是当我使用简化模型并重写model$call$function中的函数时,dredge忽略了这个更改并使用简化模型而不是完整模型。
glmmTMB-package 的功能是否还有其他解决方法?
下面是一些示例代码:
# The full_model does not converge
full_model <- glmmTMB(y ~ x1 * x2 * (x3 + x4 + x5 + x6) + (1|RE1/RE1.1/RE1.2) + (1|RE2), data = df, family = "nbinom2")
# The simple_model does converge
simple_model <- glmmTMB(y ~ x1 + x2 + x3 + x4 + x5 + x6 + (1|RE1/RE1.1/RE1.2) + (1|RE2), data = df, family = "nbinom2")
# Change formula in the model
simple_model$call$formula <- y ~ x1 * x2 * (x3 + x4 + x5 + x6) + (1|RE1/RE1.1/RE1.2) + (1|RE2)
# use dredge, but this ignores the changed formula
dredge(simple_model)
谢谢!
【问题讨论】: