如何在 Rstudio 中运行 python 脚本答案

【问题标题】：How to run python script in Rstudio如何在 Rstudio 中运行 python 脚本
【发布时间】：2018-04-02 20:40:47
【问题描述】：

我对如何从 Rstudio 运行 python 脚本有疑问？

我最初的想法是从 GitHub 存储库中获取 python 脚本，然后在 R 中运行它，我使用 RCurl 包中的script <- getURL(URL, ssl.verifypeer = FALSE) 获取了 python 代码，我一直不知道如何运行Python代码没有将脚本作为文件存储在工作目录中，即在Rstudio中运行上述目录中的R变量script。

我确实知道 R 中 _rPython_ 包中的 python.load() 可以帮助运行 Python 脚本，但它需要 .py 文件作为第一个参数。我想找到一种不将 Python 脚本存储为文件的方法。

如果您对此问题有任何想法，请提前感谢您。

【问题讨论】：

你能告诉我更多关于你得到script对象的url吗？ script 的对象是什么样的？
查看reticulate 包：blog.rstudio.com/2018/03/26/reticulate-r-interface-to-python
如果你下载脚本，那么你可以说system("python path/to/script.py")
@FredBoehm，该 URL 可以通过 cilck Raw 按钮从 Github 存储库中找到任何 python 代码以生成 .e.g. link 和来自script <- getURL(URL, ssl.verifypeer = FALSE) 的script 是一个字符向量，它是该URL 中的所有内容（代码）。
@lefft 谢谢，我知道，但我想找到一种无需下载脚本的方法。

标签： python r rpython

【解决方案1】：

确保您正在运行 R Markdown 文件并安装了 reticulate。

加载和配置您的 Python 版本：

```{r setup, include = FALSE}
library(reticulate)
use_python("usr/local/bin/python")
```

那么，任何python代码都可以调用如下：

```{python}
# write python
# code here
```

如果您创建任何全局 python 对象并希望将它们与R 代码一起使用，只需在它们前面加上py$；例如访问在 R 块中使用名为 my_data 的 python 创建的数据框：

```{r}
head(py$my_data)
```

更多详情请见here。

【讨论】：

伟大的开始。有没有办法用参数调用脚本并获取 python 脚本的标准输出？例如，py_output <- %run ./mypythonscript.py arg1 arg2 ... ?
我刚刚遇到this：“获取 Python 脚本 — source_python() 函数使您能够像 source() R 脚本一样获取 Python 脚本（Python 函数和对象已定义脚本中的内容可直接用于 R 会话）。