编织 Rmarkdown 文档时出错：bzfile 中的错误（文件名，“rb”）：无法打开连接答案

【问题标题】：Error knitting Rmarkdown doc: Error in bzfile(filename, "rb") : cannot open the connection编织 Rmarkdown 文档时出错：bzfile 中的错误（文件名，“rb”）：无法打开连接
【发布时间】：2014-08-24 16:33:53
【问题描述】：

所以我正在尝试编写我在 Coursera 上的作业的代码，但我遇到了一个奇怪的错误，我无法找出问题所在。这是我认为是问题的代码

setInternet2(use = TRUE)


fileUrl<- "https://d396qusza40orc.cloudfront.net/repdata%2Fdata%2FStormData.csv.bz2"

download.file(fileUrl, destfile = "c:/Users/musto101/Dropbox/DataScience/ReproducibleResearch/Assignment2/data/stormData.csv.bz2")



dateDownloaded<- date()

library(R.utils)



stormData<-bunzip2( filename = "stormData.csv", destname = "stormData3.csv")



head(stormData)

和错误：

Quitting from lines 13-35 (PA2.Rmd) 
Error in bzfile(filename, "rb") : cannot open the connection
Calls: <Anonymous> ... eval -> eval -> bunzip2 -> bunzip2.default -> bzfile
In addition: Warning messages:
1: package 'R.utils' was built under R version 3.1.1 
2: package 'R.oo' was built under R version 3.1.1 
3: package 'R.methodsS3' was built under R version 3.1.1 
4: In bzfile(filename, "rb") :
  cannot open bzip2-ed file 'stormData.csv', probable reason 'No such file or directory'
Execution halted

那么有人知道这里发生了什么吗？任何建议将不胜感激。

谢谢

【问题讨论】：

试试download.file(..., mode="wb")
试过了，还是一样的错误。问题似乎出在 bunzip() 函数中...

标签： r csv knitr r-markdown bzip2

【解决方案1】：

看起来您忘记了输入文件名上的 .BZ2 后缀。下面的代码应该可以解决这个问题。

stormData<-bunzip2( filename = "stormData.csv.bz2", destname = "stormData3.csv")

【讨论】：

【解决方案2】：

放一个

require(R.utils)

在该块的顶部，它会正常工作。我遇到过同样的问题。我也有其他一些软件包，比如 dplyr。相同的分辨率或输入R.utils:::bunzip2()

【讨论】：