相关矩阵问题

Question

下午好， 我是 Rstudio 的初学者，我需要为此创建一个相关矩阵：

cor (final_base, method = "pearson")

但由于我在数组中得到了许多 NA 变量，因此我尝试输入：

cor (final_base, method = "pearson", na.rm = TRUE)

这样我就不会在矩阵中计算此类数据，但那时我收到一条错误消息：

unused argument (na.rm = TRUE)

如何制作矩阵，但不考虑数据库的 NA？

谢谢

Answer 1

这是因为na.rm 不是cor 函数的有效参数。请改用参数use，它是“一个可选字符串，提供了一种在存在缺失值的情况下计算协方差的方法”。在您的情况下，您可以将其设置为 "complete.obs"，如下所示：

cor(final_base, method = "pearson", use = "complete.obs")

请参阅文档here。

另外，请查看 this 关于令人困惑（因此不鼓励）"pairwise.complete.obs" 选项的注释，以及是否首先从相关矩阵中排除缺失值。相反，请考虑明确说明这些缺失：

如果您想对大量具有缺失值的向量运行相关性，请考虑简单地使用 R 默认值 use = "everything" 并将缺失值传播到相关性矩阵中。这让你不知道什么一目了然。