【发布时间】:2015-05-25 21:24:28
【问题描述】:
如何使用 subgraph 函数获取仅包含特定连接组件的顶点和边的图?假设我知道连通组件 id,最终目标是基于连通组件创建一个新图。我想保留原始图中的顶点属性。
【问题讨论】:
如何使用 subgraph 函数获取仅包含特定连接组件的顶点和边的图?假设我知道连通组件 id,最终目标是基于连通组件创建一个新图。我想保留原始图中的顶点属性。
【问题讨论】:
您必须将带有组件ID的图加入原始图,通过组件ID过滤(取子图),然后丢弃组件ID。
import scala.reflect._
import org.apache.spark.graphx._
import org.apache.spark.graphx.lib.ConnectedComponents
def getComponent[VD: ClassTag, ED: ClassTag](
g: Graph[VD, ED], component: VertexId): Graph[VD, ED] = {
val cc: Graph[VertexId, ED] = ConnectedComponents.run(g)
// Join component ID to the original graph.
val joined = g.outerJoinVertices(cc.vertices) {
(vid, vd, cc) => (vd, cc)
}
// Filter by component ID.
val filtered = joined.subgraph(vpred = {
(vid, vdcc) => vdcc._2 == Some(component)
})
// Discard component IDs.
filtered.mapVertices {
(vid, vdcc) => vdcc._1
}
}
【讨论】:
getComponent 的参数之一引入,从而节省可能昂贵的重新计算任务。我很好奇为什么这个功能可以工作,但是当我手动执行这些步骤时,将Long 或任何作为component 的内容都失败了。必须强制转换为Some 或VertexId?
ConnectedComponents之前如何拥有一个组件ID。我想我只是想在某处包含ConnectedComponents。我将重新编写代码以使其更明智。对于您的其他问题:VertexId 是Long 的别名。一个普通的旧号码应该在那里工作。这里的“失败”是什么意思?你有例外吗?
cc.vertices.values.distinct.count。
我认为您的问题是,给定源图中的 VertexId,创建一个新图,其中节点和边从源图中连接到该 VertexId。
鉴于此,我会这样做:
val targetVertexId = ...
val graph = Graph(..., ...)
val newGraph = Graph(
graph.vertices.filter{case (vid,attr) => vid == targetVertexId} ++
graph.collectNeighbors(EdgeDirection.Either)
.filter{ case (vid,arr) => vid == targetVertexId}
.flatMap{ case (vid,arr) => arr},
graph.edges
).subgraph(vpred = { case (vid,attr) => attr != null})
需要注意的几点:
您可以根据需要将EdgeDirection.Either 更改为EdgeDirection.In 或EdgeDirection.Out。
末尾的.subgraph 删除属性设置为null 的所有顶点。如果原始val graph 的顶点属性设置为null,这将不起作用。否则,这可以工作,而无需事先知道 Vertex 属性类型。
【讨论】: