计算R中每个标签号之间的距离答案

【问题标题】：Calculate distance between each tag number in R计算R中每个标签号之间的距离
【发布时间】：2015-06-23 19:07:28
【问题描述】：

我正在尝试计算 R 中每个树的标记数之间的欧几里德距离。我的数据集大约有 43000 行。我正在使用

mat.co <- cbind(co.trees$gx, co.trees$gy)
m <- as.matrix(head(dist(mat.co, diag = TRUE, upper = TRUE)))
as.dist(m, diag = TRUE, upper = TRUE)

我的问题是：

1) 矩阵不会产生我想要的列名和行名。现在列名和行名是 1、2、3 等。我希望列名和行名都是树的标签号，这样我就可以找出相对距离。

另外，矩阵不显示 1 和 1 之间的距离，应该是 0。这也导致了后面部分的问题，这里我使用了as.dist。

2) 当我申请as.dist 时，距离值与相应的标签号不匹配。现在，除了之前没有出现的 0 值之外，下一个值也丢失了。

我在代码行#2 中使用了head，因为我收到了一条到达 R 内存限制的错误消息。我是 R 新手；非常感谢任何详细的解释！非常感谢你！

【问题讨论】：

我发现如果我首先使用这个：as.dist(head(mat.co, diag= TRUE, upper = TRUE))，紧接着cbind，它实际上在行和列中给了我正确的标签号。但显示的值是标签号的 x 坐标。如何让 R 输入在相应列和行中计算的距离？
下次如果您寻求帮助，请至少添加语言标签
@DavidArenburg 谢谢你的提醒。

【解决方案1】：

我意识到以下代码行可以生成带有我想要的标签号的距离值。

n <- dist(head(cbind(co.trees$gx, co.trees$gy)))

n <- as.matrix(n)

colnames(n) <- head(co.trees$tag)

rownames(n) <- head(co.trees$tag)

【讨论】：