如何在 r 循环中运行函数答案

【问题标题】：How to run a function in a r loop如何在 r 循环中运行函数
【发布时间】：2020-02-05 13:43:57
【问题描述】：

我有一个包含一组基因组坐标的数据框。我希望使用nearest.gene() 在这些坐标周围找到基因，一次打印一个结果。我一直在努力循环运行该函数：

apply(gene_lst, 1, function (x) nearest.gene(chr=gene_lst$Chr, pos=gene_lst$Pos))
      1       2       3       4       5       6       7       8       9      10 
"ACBD3" "ACBD3" "ACBD3" "ACBD3" "ACBD3" "ACBD3" "ACBD3" "ACBD3" "ACBD3" "ACBD3"

它正在覆盖接下来九个坐标的第一个输出。有没有更好的方法来运行这个函数？

【问题讨论】：

在您的 apply 函数中，您没有将 x 传递给您的函数 nearest.gene()
感谢您指出这一点。
解决问题了吗？希望它运作良好......
是的，确实如此。再次感谢您的帮助。
太棒了！如果您认为我的回答有帮助，请随时点赞/接受。谢谢:)

标签： r loops apply

【解决方案1】：

我想你可以试试下面的代码，你应该将x 传递给你的函数nearest.gene()

apply(gene_lst, 1, function (x) nearest.gene(chr=x["Chr"], pos=x["Pos"]))

【讨论】：