R/data.table：使用 fread 读取多行脚本答案

【问题标题】：R/data.table: read multiline script with freadR/data.table：使用 fread 读取多行脚本
【发布时间】：2017-02-06 18:34:05
【问题描述】：

我正在使用 data.table::fread 从 shell 脚本读取输入。为了便于阅读，我想使用行继续符“\”将脚本拆分为多行。

但是，fread 似乎不喜欢多行的 shell 脚本。

例子：

library(data.table)
fread("cat test1.txt test2.txt") ## OK

现在将脚本分成两行：

fread("cat test1.txt \
           test2.txt")
Error in fread("cat test.txt \n           test.txt") : 
  Expected sep (' ') but new line, EOF (or other non printing character) ends field 0 when detecting types (   first):            test.txt

## Same problem
fread("cat test.txt \\
           test.txt")

我缺少任何转义序列或开关吗？

如果不是，我猜这些是可能的解决方案：1）根本不拆分脚本 2）将脚本写入文件并使用 fread 调用该文件。

这些是我的设置：

sessionInfo()
R version 3.2.3 (2015-12-10)
Platform: x86_64-redhat-linux-gnu (64-bit)
Running under: CentOS release 6.7 (Final)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=en_GB.UTF-8        LC_COLLATE=en_GB.UTF-8     LC_MONETARY=en_GB.UTF-8    LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8    LC_PAPER=en_GB.UTF-8       LC_NAME=C                  LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] data.table_1.10.4

loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_3.2.3  chron_2.3-46 tcltk_3.2.3

【问题讨论】：

通过包含换行符，您会触发fread 相信您的输入是 csv，而不是命令行脚本。如果您想节省空格，请使用 R 本身，而不是命令行，例如，fread(paste0('cat test.txt', 'test.txt'))
@MichaelChirico 似乎值得添加您的评论作为答案？

标签： r shell data.table

【解决方案1】：

嵌入paste 是一种替代方法：

fread(paste("cat test1.txt",
           "test2.txt"))

如果您正在寻找一种读取多个文本文件的简单方法，您可以使用

fread("cat t*.txt")

或者如果 .txt 文件不遵循上述文件名示例模式，则可能将它们移动到子目录（例如“数据”）并按如下方式全部读取：

fread("ls data | cat")

【讨论】：