在 R 中制作对数刻度直方图答案

【问题标题】：Make Log Scale Histogram Plot in R在 R 中制作对数刻度直方图
【发布时间】：2015-04-05 00:55:26
【问题描述】：

我正在尝试将我拥有的数据绘制为从 0 到 1 的对数刻度的直方图。我尝试只导入我的数据并像这样绘制：

allelefreq <- read.table("allelefreqs.txt", header = TRUE)
allelefreq <- sapply(allelefreq, as.numeric) #convert to numbers
hist(allelefreq, xlim = range(0:1))

但这只是在 0 处向我显示了一个大条，然后为绘图的其余部分显示了空白空间，并且显然不是对数刻度。

我也尝试过使用 ggplot 来做到这一点，但没有成功。部分问题可能是我有大量数据，其中包含接近 0 的非常小的数字，我认为更小的 bin 将有助于解决这个问题，因为它们会被更多地分开。

我不知道是否可以在直方图上创建非常小的 bin，或者在某个点切割 y 轴以显示所有内容。但是有人知道如何绘制这个吗？

我的数据很简单，看起来像这样（尽管有大约 10,000 个样本）：

【问题讨论】：

“从 0 到 1 的对数刻度直方图”对您意味着什么？
您已从直方图中提取数据？您的样本数据也涵盖了许多数量级。我会先尝试对数据进行子集化。顺便说一句，在这种情况下将 xlim 设置为 (0,1) 并没有什么意义。
我希望 X 轴绘制在最大值为 1 的对数刻度上。不，我没有从直方图中提取数据，但我有想要的数据绘制为直方图。
这一切都清楚了。
酷。是的，我想我的代码错误可能有点误导。

标签： r plot

【解决方案1】：

以防万一有人回头寻找答案。这是我用来解决这个问题的代码：

allelefreq <- read.table("allelefreqs.txt", header = TRUE)
hist(log(allelefreq$AlleleFreq), xlim = c(-15,1), breaks=100)

【讨论】：