【发布时间】:2015-11-02 11:33:54
【问题描述】:
我只想用不同的颜色表示一系列分类状态。
这种情节也称为individual sequence plot(TraMineR)。
我想使用ggplot2。
我的数据看起来像这样
> head(dta)
V1 V2 V3 V4 V5 id
1 b a e d c 1
2 d b a e c 2
3 b c a e d 3
4 c b a e d 4
5 b c e a d 5
在最后一列中使用personal id。
剧情是这样的。
每个letters(状态)都由一种颜色表示。基本上,这个图可视化了每个人的连续状态。
蓝色是a,红色是b,紫色是c,黄色是d,棕色是e。
知道如何使用ggplot2 做到这一点吗?
dta = structure(list(V1 = structure(c(1L, 3L, 1L, 2L, 1L), .Label = c("b",
"c", "d"), class = "factor"), V2 = structure(c(1L, 2L, 3L, 2L,
3L), .Label = c("a", "b", "c"), class = "factor"), V3 = structure(c(2L,
1L, 1L, 1L, 2L), .Label = c("a", "e"), class = "factor"), V4 = structure(c(2L,
3L, 3L, 3L, 1L), .Label = c("a", "d", "e"), class = "factor"),
V5 = structure(c(1L, 1L, 2L, 2L, 2L), .Label = c("c", "d"
), class = "factor"), id = 1:5), .Names = c("V1", "V2", "V3",
"V4", "V5", "id"), row.names = c(NA, -5L), class = "data.frame")
到目前为止我尝试了什么
nr = nrow(dta3)
nc = ncol(dta3)
# space
m = 0.8
n = 1 # do not touch this one
plot(0, xlim = c(1,nc*n), ylim = c(1, nr), type = 'n', axes = F, ylab = 'individual sequences', xlab = 'Time')
axis(1, at = c(1:nc*m), labels = c(1:nc))
axis(2, at = c(1:nr), labels = c(1:nr) )
for(i in 1:nc){
points(x = rep(i*m,nr) , y = 1:nr, col = dta3[,i], pch = 15)
}
但它不是ggplot2 并且不是很令人满意。
【问题讨论】:
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你已经尝试过什么了吗?
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实际上没有 - 我不知道从哪里开始
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我认为你需要搜索的词是'heatmap' /ggplot2。
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但它实际上不是热图,它不涉及计算。
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这里的通用方法是融合你的数据,然后使用 geom_tile。
标签: r plot ggplot2 sequence data-visualization