总是重新安装包答案

【问题标题】：Always reinstalling packages总是重新安装包
【发布时间】：2018-06-04 10:15:31
【问题描述】：

我只需要解决我的 RStudio 的问题。我在 R & RStudio 上都有最新版本，但每次我重新启动 PC 广告打开程序时，它都会告诉我一些软件包没有安装。几次之后，我注意到有问题的包是：stringi、MASS、survival 或 Rcpp。

此外，如果我必须安装另一个依赖于它们的软件包，则会出现警告，指出所提到的软件包未更新，它让我可以选择全部更新。

我尝试重新安装它们并以管理员身份进入 RStudio，但没有任何效果，有谁知道这里发生了什么？感谢您的帮助。

【问题讨论】：

标签： r rstudio

【解决方案1】：

R 包被安装到库中。 R 搜索的库的位置由.libPaths() 的值决定。您可能在多个库中安装了有问题的软件包；例如，检查dir(.libPaths()[1]) 和dir(.libPaths()[2]) 中是否安装了相同的软件包。

使用remove.packages() 和lib= 参数来删除一个安装。

我的做法是仅在默认库中安装 R 和 基础包（可能以管理员身份），并将所有其他包安装在我作为普通用户可以访问的库中。个人库是.libPaths() 中的第一个条目，这是安装包的默认位置。有关如何设置库，请参阅?.libPaths；所有库路径都必须存在，否则 R 会默默地将它们从 .libPaths() 中删除。我使用~/.Renviron 中的设置。因此

> .libPaths()
[1] "/home/mtmorgan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5-Bioc-3.8"  # personal
[2] "/home/mtmorgan/bin/R-3-5-branch/library"                    # base
> sapply(.libPaths(), function(path) length(dir(path)))
/home/mtmorgan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5-Bioc-3.8 
                                                      236 
                  /home/mtmorgan/bin/R-3-5-branch/library 
                                                       30

【讨论】：

感谢您的帮助！一直在重新安装软件包很痛苦。
关于 OP 的问题“但是每次我重新启动 PC 广告打开程序时，它都会告诉我某些软件包未安装”，如果软件包安装在多个库中，为什么会发生这种情况？