如何在 ggplot 中重新排列热图 y 轴上的对象？ [复制]答案

【问题标题】：How can I reorder the objects on the y-axis of my heatmap in ggplot? [duplicate]如何在 ggplot 中重新排列热图 y 轴上的对象？ [复制]
【发布时间】：2020-05-23 13:41:58
【问题描述】：

这是我目前拥有的：

heat=read.csv("heat.csv")
head(heat)
heat$trap <- as.character(heat$trap)
class(heat$trap)
levels(heat$trap) <- c("T1", "T2", "T3", "T4","T5", "T6", "T7", "T8", "T9", "T10")

saeat <- ggplot(data = heat, mapping = aes(x = trip, y = trap, fill = sand)) + geom_tile() + ylab(label = "Trap") + xlab(label = "Month") + scale_fill_gradient(name = "Proportion of eggs", low = "#000033", high = "#FFFF33")
saeat

sand.heat <- veat + theme(strip.placement = "outside",plot.title = element_text(hjust = 0.5), axis.title.y = element_blank(), strip.background = element_rect(fill = "#EEEEEE", color = "#FFFFFF")) + ggtitle(label = "Sand treatment") + scale_y_discrete(breaks=c("T1", "T2", "T3", "T4","T5", "T6", "T7", "T8", "T9", "T10"))

swallows.heat

我找不到以这种方式排列我的 y 轴的方法：T1 到 T10。但是 T10 在 T1 之后就结束了。关于如何改变这一点有什么建议吗？

【问题讨论】：

按字典顺序进行排序，其中"T10" 位于"T2" 之前。任何关于在轴上排序的问题都可以归结为：将 y 轴变量转换为一个因子并强制水平，如factor(..., levels=...)。

标签： r ggplot2 heatmap axes

【解决方案1】：

我不确定是否以相同的方式使用 character 变量，但如果您使用 factor 变量，您可以按照您想要的方式重新排序级别。

# make a factor variable
heat$trap <- as.factor(heat$trap)

# check the current levels
levels(heat$trap)
[1] "T1"  "T10" "T2"  "T3"  "T4"  "T5"  "T6"  "T7"  "T8"  "T9"

# reorder the levels
heat$trap <- factor(heat$trap, levels = levels(heat$trap)[c(1, 3:10, 2)])

# check the correct order
levels(heat$trap)
[1] "T1"  "T2"  "T3"  "T4"  "T5"  "T6"  "T7"  "T8"  "T9"  "T10"

【讨论】：

像这样对索引进行硬编码有点脆弱。我建议找到一种以编程方式执行此操作的方法，例如 levels(heat$trap)[ order(as.integer(gsub("\\D", "", levels(heat$trap)))) ]。
谢谢 - 效果很好！