在连续 x 轴上具有二进制结果变量的热图 - 有可能吗？答案

【问题标题】：Heatmap with binary outcome variables on a continous x-axis - is it possible?在连续 x 轴上具有二进制结果变量的热图 - 有可能吗？
【发布时间】：2019-06-21 09:23:34
【问题描述】：

编造数据

Years (row): 0.5, 0.5, 1.1, 2.0

A: (column 1): 1, 0, 1, 1

B: (column 2): 0, 0, 1, 1

C: (column 3): 0 ,1 ,0, 0

我尝试在 R 中为我的数据制作热图，我希望在 Y 轴和 x 轴上获得不同标记（A、B、C）的结果，我会喜欢有年份（> 200个数据）。

我尝试了许多不同的方法和组合，但不知何故我无法让它发挥作用。

我正在使用 R，我尝试使用 ggplot

library(ggplot2)
ggplot(Data,aes(x=Years,y=markers,fill=factor(Positive/Negative)))+geom_tile()

我知道这是不正确的，但我就是不知道如何让它发挥作用。

【问题讨论】：

标签： r ggplot2 binary heatmap

【解决方案1】：

类似的东西？您需要融合您的数据，以便您可以将年份和类用作标签，并将您的值用作填充值：


library(data.table)
df <- fread(
'Years      A    B   C
0.19       1    0   0   
0.21       0    1   1   
1.00       0    0   1
2.25       1    0   1'
)

library(tidyverse)

df %>% melt(id.vars = 'Years') %>% 
  ggplot(aes(x = as.factor(Years), y = as.factor(variable), 
             fill = as.factor(value))) +
  geom_tile() +
  scale_fill_manual(values = c('black', 'white')) +
  labs(x = 'year', y = 'marker',fill = 'result')

【讨论】：

是的，这正是我一直试图做的。非常感谢，我会试试看能不能成功。