在 RMarkdown 中使用 tikz graphdrawing 库...需要使用 lualatex 引擎，但无法使其工作答案

【问题标题】：Using tikz graphdrawing library within RMarkdown ... Need to use lualatex engine, but can't get it to work在 RMarkdown 中使用 tikz graphdrawing 库...需要使用 lualatex 引擎，但无法使其工作
【发布时间】：2018-03-10 18:00:46
【问题描述】：

我在rmd 文件中有以下代码，该文件利用tikz 绘制图表：

---
title: "TestNonTufteLua"
author: "Me"
output:
  pdf_document :
    latex_engine: lualatex
---

Prove tikz works:
```{r tikTest1, engine = "tikz"}
\usetikzlibrary{shapes}
\begin{tikzpicture}
    \node[ellipse, draw=black, align = center] (Data) {Data $y_{n}$};
\end{tikzpicture}
```

Then, when you set `eval = TRUE` in the below code, it will not work. 
```{r tikTest2, eval = FALSE, engine = "tikz"}
\usetikzlibrary{graphs, graphdrawing}
\usegdlibrary{layered}
\tikz [gr/.style={gray!50}, font=\bfseries]
\graph [layered layout] {
    % A and F are horizontally aligned if you also set weight=0.5 for A -- C.
    A -- [minimum layers=2] C -- F,
    { [nodes=gr, edges=gr] A -- B -- { E, D -- F } }
};
```

在第二个块中更改为eval=TRUE 时，我得到以下信息错误：

从第 24-29 行退出 (testNonTufteLua.Rmd) 错误：正在运行 '.\tikz36747a021b22.tex' 上的 'texi2dvi' 失败

LaTeX 错误：rarygraphdrawing.code.tex:22: Package pgf Error: You 需要运行 LuaTeX 才能使用图形绘制库。

使用 RStudio 中的 knit 按钮或使用 render("testNonTufteLua.Rmd", output_format = pdf_document(keep_tex = TRUE, latex_engine = "lualatex") 时会出现此错误。我还尝试过设置options(tikzDefaultEngine = "luatex") 来让tikzDevice 正确处理它，但它仍然无法正常工作。即使可以加载tikz-shapes 库并且文档的其余部分似乎是用lualatex 编译的，我似乎也无法让graphdrawing 库工作。感谢您的帮助！

【问题讨论】：

标签： knitr r-markdown tikz tikzdevice

【解决方案1】：

更新：同时knitr 不再使用tools::texi2dvi 而是tinytex::latexmk。因此，必须在设置块中使用options(tinytex.engine = 'lualatex')。

这相当棘手，因为您使用的不是tikzDevice，而是tikz 引擎，它使用tools::texi2dvi 转换为PDF。您可以使用options(texi2dvi = "lualatex") 更改此设置。但是，默认模板不适用于 LuaLaTeX。因此，我创建了一个修改过的模板：

\RequirePackage{luatex85}
\documentclass{article}
\usepackage[luatex,active,tightpage]{preview}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{tikz}
\usetikzlibrary{matrix}
\begin{document}
\begin{preview}
%% TIKZ_CODE %%
\end{preview}
\end{document}

并使用engine.opts = list(template = "tikz2pdf.tex") 指定该文件。把它们放在一起我的工作文件：

---
title: "TestNonTufteLua"
author: "Me"
output:
  pdf_document :
    latex_engine: lualatex
---

```{r}
options(texi2dvi = "lualatex")
```

```{r tikTest2, eval = TRUE, engine = "tikz", engine.opts = list(template = "tikz2pdf.tex")}
\usetikzlibrary{graphs, graphdrawing}
\usegdlibrary{layered}
\tikz [gr/.style={gray!50}, font=\bfseries]
\graph [layered layout] {
    % A and F are horizontally aligned if you also set weight=0.5 for A -- C.
    A -- [minimum layers=2] C -- F,
    { [nodes=gr, edges=gr] A -- B -- { E, D -- F } }
};
```

结果：

参考资料：

【讨论】：

【解决方案2】：

上面示例的一个小的运行变体如下使用tinytex。

    ---
    title: "lualatex. Using `tinytex.engine`"
    output:
      html_document:
        df_print: paged
      pdf_document:
        latex_engine: lualatex
    ---

   ## Latex engines
   By default, PDF documents are rendered using `pdflatex`. You can specify an
   alternate engine using the `latex_engine` option. Available engines 
   are `pdflatex`, `xelatex`, and `lualatex.` 

    ```{r setup}
    options(tinytex.engine = "lualatex")
    ```

    ```{r tikzLua, eval = TRUE, engine = "tikz", engine.opts = list(template =  "tikz2pdf.tex")}
    \usetikzlibrary{graphs, graphdrawing}
    \usegdlibrary{layered}

   \tikz [gr/.style={gray!50}, font=\bfseries]
   \graph [layered layout] {
    % A and F are horizontally aligned if you also set weight=0.5 for A -- C.
    A -- [minimum layers=2] C -- F,
    { [nodes=gr, edges=gr] A -- B -- { E, D -- F } }
    };
    ```

在knitr 更新后，上面的示例停止运行。

【讨论】：