在 lme4 中隐藏警告消息答案

【问题标题】：Hide warning message in lme4在 lme4 中隐藏警告消息
【发布时间】：2018-04-15 18:35:11
【问题描述】：

我在运行 lmer 时收到此警告消息。我知道为什么会这样。有什么办法可以隐藏吗？

fixed-effect model matrix is rank deficient so dropping 1 column / coefficient

【问题讨论】：

标签： r lme4

【解决方案1】：

这是一个消息（a milder form of informational message than a warning：警告使用前缀Warning message:），所以你可以使用suppressMessages()：

library(lme4)
ss <- transform(sleepstudy,Days2=Days)  ## create duplicate variable
m1 <- lmer(Reaction~Days+Days2+(1|Subject),ss)
## fixed-effect model matrix is rank deficient so dropping 1 column / coefficient
m2 <- suppressMessages(lmer(Reaction~Days+Days2+(1|Subject),ss))

但是，您可以通过包含control=lmerControl(check.rankX="silent.drop.cols") 来告诉lmer 禁止仅显示此消息：

m3 <- update(m1, control=lmerControl(check.rankX="silent.drop.cols"))

一般来说，如果可能的话，最好首先在模型中避免这些共线项（尽管它们是无害的）。（我看到 OP 说他们知道发生了什么，所以这些信息更适合未来的读者。）您可以通过查看模型矩阵的属性来查看正在删除哪些变量：

attr(getME(m2,"X"),"col.dropped")
## Days2 
#3    3

【讨论】：