在 R 中使用 pheatmap 绘制相关性时，您可以绘制下三角矩阵图还是上三角矩阵图？答案

【问题标题】：Can you have a lower or upper triangular matrix plot when plotting correlations using pheatmap in R?在 R 中使用 pheatmap 绘制相关性时，您可以绘制下三角矩阵图还是上三角矩阵图？
【发布时间】：2020-07-01 06:19:00
【问题描述】：

假设我们使用 corrplot 中的 mtcars 数据。我们如何使用 pheatmap 获得三角矩阵图？

library(corrplot)
library(pheatmap)

M <- cor(mtcars)
pheatmap(M)

【问题讨论】：

你为什么坚持pheatmap()？ corrplot(M, method = "color", type = "lower", addgrid.col = "grey") 不是你想要的？
@DarrenTsai 我需要来自 pheatmap 的树状图。

标签： r pheatmap

【解决方案1】：

这是从pheatmap 获取三角矩阵图的简单方法。

M[lower.tri(M)] <- NA
pheatmap(M, cluster_rows=F, cluster_cols=F, na_col="white")

【讨论】：