corrplot 导致奇怪的错误答案

【问题标题】：corrplot causing weird errorcorrplot 导致奇怪的错误
【发布时间】：2015-02-17 00:11:39
【问题描述】：

我在下面定义了两个集合矩阵：

它们包含来自两个变量之间 t 检验的 p 值（我知道这是不好的统计做法）

我正在尝试使用 corrplot 包中的相关图来绘制它们

但是，当我使用以下行时：

corrplot(weird, insig = "p-value", p.mat = weird, type = "lower", sig.level = 1-0.95, method = "circle", is.corr = FALSE,  cl.lim=c(0,1), tl.offset=0.4)

正常矩阵显示正确，但奇怪的矩阵没有。这让我很沮丧，我已将问题缩小到 insig="p-value" 参数，因为 corrplot 函数在没有它的情况下按预期工作。

weird<-structure(c(2.22044604925031e-16, 0.018443376602325, 2.12390642555483e-12, 
2.22044604925031e-16, 0.018443376602325, 2.22044604925031e-16, 
2.22044604925031e-16, 2.22044604925031e-16, 2.12390642555483e-12, 
2.22044604925031e-16, 3.00501193636783e-06, 2.5333487645982e-12, 
2.22044604925031e-16, 2.22044604925031e-16, 2.5333487645982e-12, 
0.0197044105270931), .Dim = c(4L, 4L), .Dimnames = list(NULL, 
    NULL))

normal<-structure(c(0.34190041513821, 0.957047560166067, 0.680056137259229, 
0.00101879090792332, 1.2138613135621e-09, 0.406147270030259, 
0.957047560166067, 0.343145355714736, 0.157301364839312, 0.0223978064844035, 
2.92279774741867e-07, 0.904700589348579, 0.680056137259229, 0.157301364839312, 
0.620933486276745, 0.000609313754058382, 2.10803751235147e-10, 
0.411208816692722, 0.00101879090792332, 0.0223978064844035, 0.000609313754058382, 
8.78613655419196e-05, 9.15187128142626e-12, 0.197743409064612, 
1.2138613135621e-09, 2.92279774741867e-07, 2.10803751235147e-10, 
9.15187128142626e-12, 0.00179242617730144, 0.0159636230788393, 
0.406147270030259, 0.904700589348579, 0.411208816692722, 0.197743409064612, 
0.0159636230788393, 1.5372324857583e-07), .Dim = c(6L, 6L), .Dimnames = list(
    NULL, NULL))

奇怪的

正常的

【问题讨论】：

据我了解，corrplot 旨在以矩阵格式绘制相关系数，可选择使用相关的 p 值（p.mat 选项）。那你为什么要绘制weird，因为它们是 p 值？
我只是想以图形形式显示 t 检验的 p 值的大小。我发现 corrplot 有一个符合我想要的图形显示。根据我的阅读，这就是为什么有 corrplot( ..., is.corr = FALSE) 选项
然后尝试绘制学生的 t-test 的值，与它们的 p 值相关联，即两个不同的矩阵，但具有相同的维度。
嗯，我不认为那是我想要做的。 p 值定义了圆的大小，然后那些 p 值超过一定数字 (0.05) 的位置得到它们的 p 值，写在圆的顶部。
我还是不明白weird 有什么奇怪的地方。这个矩阵的几乎所有值都是零。

标签： r r-corrplot

【解决方案1】：

好的，我已经解决了。

没有任何 p 值大于sig.level 要求的值，它们都小于 0.05。一旦我将一个值编辑为大于 0.05，它就会起作用

例如。

weird[1,1] <- 0.1
corrplot(weird)

作品

【讨论】：